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dudusdau

木虫 (正式写手)


[资源] 表型组相关

随着二代测序技术的发展,在育种群体中获取标记数据的成本在不断降低,这有利于研究人员更好的定位与某些表型相关的数量性状位点,然而,对相关表型的QTL进行准确的定位需要高质量的表型数据。
第一本书主要讲述了如何获取表型组学数据。
1.Phenomics How Next-Generation Phenotyping is Revolutionizing Plant Breeding。
第二本书主要讲述了利用R软件对形态进行分析,这可以适用于叶形态,鱼形态的分析,利用获得的形态数据可以完成数量性状位点的定位。
2.Morphometrics with R。
如果大家对形态的数量性状位点定位感兴趣可以联系我。
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简单说说 怎么获得高质量的表行数据。尤其是在大田试验中,表型的测定本来就有一定的误差范围,如何进一步提升?
2楼2015-04-02 16:32:22
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dudusdau

木虫 (正式写手)


引用回帖:
2楼: Originally posted by lonerice at 2015-04-02 16:32:22
简单说说 怎么获得高质量的表行数据。尤其是在大田试验中,表型的测定本来就有一定的误差范围,如何进一步提升?

你好,我简单谈以下我所接触的实验,不过不是大田实验都是室内实验。1. 某植物幼苗根生长形态测定,这里我们利用成像系统 获得了一个群体根在不同时间段的2D或者3D 形态,利用形态分析技术对这些图像处理,获得一些关键数据(作为表型)能够刻画根的形态。2. 使用表型组学平台,对某一杂交群体的不同生长阶段43个表型进行了测定。对于大田实验,我不清楚,不过书中第六章有介绍,不过我听过有人用核磁共振对大田玉米的根结构进行扫描。

我觉得对一些表型可以直接进行测量,可能误差也不太大,但一些表型例如叶形态,根形态等 利用图像处理技术可以更准确的量化。在就是目前的表型组平台,但不适合大田。
4楼2015-04-03 12:44:21
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引用回帖:
4楼: Originally posted by dudusdau at 2015-04-03 12:44:21
你好,我简单谈以下我所接触的实验,不过不是大田实验都是室内实验。1. 某植物幼苗根生长形态测定,这里我们利用成像系统 获得了一个群体根在不同时间段的2D或者3D 形态,利用形态分析技术对这些图像处理,获得一些 ...

哦。明白了。谢谢。
5楼2015-04-03 16:23:01
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简单回复
315692183楼
2015-04-03 11:19   回复  
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2015-07-11 08:15   回复  
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