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Computational Physics Simulation Of Classical And Quantum Systems
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Part I Numerical Methods 1 Error Analysis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 1.1 Machine Numbers and Rounding Errors . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 1.2 Numerical Errors of Elementary Floating Point Operations . . . . . . 6 1.2.1 Numerical Extinction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6 1.2.2 Addition . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7 1.2.3 Multiplication . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8 1.3 Error Propagation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8 1.4 Stability of Iterative Algorithms . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 1.5 Example: Rotation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 1.6 Truncation Error . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13 Problems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13 2 Interpolation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15 2.1 Interpolating Functions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15 2.2 Polynomial Interpolation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 2.2.1 Lagrange Polynomials . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 2.2.2 Newton’s Divided Differences . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 2.2.3 Interpolation Error . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18 2.2.4 Neville Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20 2.3 Spline Interpolation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 2.4 Multivariate Interpolation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25 Problems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26 3 Numerical Differentiation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29 3.1 Simple Forward Difference . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29 3.2 Symmetrical Difference Quotient . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30 3.3 Extrapolation Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31 3.4 Higher Derivatives . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33 3.5 More Dimensions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34 Problems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 ix x Contents 4 Numerical Integration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37 4.1 Equidistant Sample Points . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37 4.1.1 Newton–Cotes Rules . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 4.1.2 Newton–Cotes Expressions for an Open Interval . . . . . . 39 4.1.3 Composite Newton–Cotes Formulas . . . . . . . . . . . . . . . . 40 4.1.4 Extrapolation Method (Romberg Integration) . . . . . . . . . 40 4.2 Optimized Sample Points . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 42 4.2.1 Clenshaw–Curtis Expressions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 42 4.2.2 Gaussian Integration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43 Problems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45 5 Systems of Inhomogeneous Linear Equations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47 5.1 Gaussian Elimination Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47 5.1.1 Pivoting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50 5.1.2 Direct LU Decomposition . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51 5.2 QR Decomposition . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51 5.3 Linear Equations with Tridiagonal Matrix . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53 5.4 Cyclic Tridiagonal Systems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 5.5 Iterative Solution of Inhomogeneous Linear Equations. . . . . . . . . . 56 5.5.1 General Treatment . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56 5.5.2 Jacobi Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 57 5.5.3 Gauss–Seidel Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 57 5.5.4 Damping and Successive Over-Relaxation . . . . . . . . . . . 58 5.6 Conjugate Gradients . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59 Problems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 60 6 Roots and Extremal Points . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63 6.1 Root Finding . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63 6.1.1 Bisection . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63 6.1.2 Regula Falsi Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64 6.1.3 Newton–Raphson Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65 6.1.4 Secant Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66 6.1.5 Roots of Vector Functions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66 6.2 Optimization Without Constraints . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 67 6.2.1 Steepest Descent Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68 6.2.2 Conjugate Gradient Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68 6.2.3 Newton–Raphson Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 69 6.2.4 Quasi-Newton Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 69 Problems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70 7 Fourier Transformation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 73 7.1 Discrete Fourier Transformation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74 7.1.1 Trigonometric Interpolation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 75 7.1.2 Real-Valued Functions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77 Contents xi 7.1.3 Approximate Continuous Fourier Transformation . . . . . 77 7.2 Algorithms . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 78 7.2.1 Goertzel’s Algorithm . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 79 7.2.2 Fast Fourier Transformation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80 Problems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 8 Random Numbers and Monte Carlo Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 87 8.1 Some Basic Statistics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 87 8.1.1 Probability Density and Cumulative Probability Distribution . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 87 8.1.2 Expectation Values and Moments. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 8.1.3 Multivariate Distributions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 92 8.1.4 Central Limit Theorem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 93 8.1.5 Example: Binomial Distribution . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 93 8.1.6 Average of Repeated Measurements . . . . . . . . . . . . . . . . 94 8.2 Random Numbers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 95 8.2.1 The Method by Marsaglia and Zamann . . . . . . . . . . . . . . 96 8.2.2 Random Numbers with Given Distribution . . . . . . . . . . . 96 8.2.3 Examples . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 97 8.3 Monte Carlo Integration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 99 8.3.1 Numerical Calculation of π . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 99 8.3.2 Calculation of an Integral . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100 8.3.3 More General Random Numbers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 101 8.4 Monte Carlo Method for Thermodynamic Averages . . . . . . . . . . . . 102 8.4.1 Simple (Minded) Sampling . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 102 8.4.2 Importance Sampling . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 103 8.4.3 Metropolis Algorithm . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104 Problems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106 9 Eigenvalue Problems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 9.1 Direct Solution . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 9.2 Jacobi Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 9.3 Tridiagonal Matrices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 111 9.4 Reduction to a Tridiagonal Matrix . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 111 9.5 Large Matrices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114 Problems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 10 Data Fitting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117 10.1 Least Square Fit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117 10.1.1 Linear Least Square Fit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 119 10.1.2 Least Square Fit Using Orthogonalization. . . . . . . . . . . . 120 10.2 Singular Value Decomposition . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 123 Problems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127 xii Contents 11 Equations of Motion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 129 11.1 State Vector of a Physical System . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 129 11.2 Time Evolution of the State Vector . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130 11.3 Explicit Forward Euler Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132 11.4 Implicit Backward Euler Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 134 11.5 Improved Euler Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 135 11.6 Taylor Series Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 137 11.7 Runge–Kutta Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 138 11.7.1 Second-Order Runge–Kutta Method . . . . . . . . . . . . . . . . 138 11.7.2 Third-Order Runge–Kutta Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . 138 11.7.3 Fourth-Order Runge–Kutta Method . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 11.8 Quality Control and Adaptive Step-Size Control . . . . . . . . . . . . . . . 140 11.9 Extrapolation Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 141 11.10 Multistep Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 11.10.1 Explicit Multistep Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 11.10.2 Implicit Multistep Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143 11.10.3 Predictor–Corrector Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 11.11 Verlet Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 11.11.1 Liouville Equation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 11.11.2 Split Operator Approximation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145 11.11.3 Position Verlet Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 146 11.11.4 Velocity Verlet Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 146 11.11.5 Standard Verlet Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 11.11.6 Error Accumulation for the Standard Verlet Method . . . 149 11.11.7 Leap Frog Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Problems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150 Part II Simulation of Classical and Quantum Systems 12 Rotational Motion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157 12.1 Transformation to a Body Fixed Coordinate System . . . . . . . . . . . . 157 12.2 Properties of the Rotation Matrix . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 158 12.3 Properties of W, Connection with the Vector of Angular Velocity . 160 12.4 Transformation Properties of the Angular Velocity . . . . . . . . . . . . . 161 12.5 Momentum and Angular Momentum . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 163 12.6 Equations of Motion of a Rigid Body . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 163 12.7 Moments of Inertia . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 164 12.8 Equations of Motion for a Rotor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 165 12.9 Explicit Solutions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 165 12.10 Loss of Orthogonality . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 167 12.11 Implicit Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 168 12.12 Example: Free Symmetric Rotor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 12.13 Kinetic Energy of a Rotor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 12.14 Parametrization by Euler Angles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172 Contents xiii 12.15 Cayley–Klein parameters, Quaternions, Euler Parameters . . . . . . . 172 12.16 Solving the Equations of Motion with Quaternions . . . . . . . . . . . . . 176 Problems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 13 Simulation of Thermodynamic Systems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 179 13.1 Force Fields for Molecular Dynamics Simulations . . . . . . . . . . . . . 179 13.1.1 Intramolecular Forces . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 179 13.1.2 Intermolecular Forces . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 180 13.1.3 Approximate Separation of Rotation and Vibrations . . . 180 13.2 Simulation of a van der Waals System . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 181 13.2.1 Integration of the Equations of Motion . . . . . . . . . . . . . . 181 13.2.2 Boundary Conditions and Average Pressure . . . . . . . . . . 182 13.2.3 Initial Conditions and Average Temperature . . . . . . . . . . 183 13.2.4 Analysis of the Results . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 183 13.3 Monte Carlo Simulation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 186 13.3.1 One-Dimensional Ising Model . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 186 13.3.2 Two-Dimensional Ising Model . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 188 Problems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 189 14 Random Walk and Brownian Motion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 193 14.1 Random Walk in One Dimension . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 194 14.1.1 Random Walk with Constant Step Size . . . . . . . . . . . . . . 195 14.2 The Freely Jointed Chain . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 196 14.2.1 Basic Statistic Properties . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 197 14.2.2 Gyration Tensor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 199 14.2.3 Hookean Spring Model . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 200 14.3 Langevin Dynamics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 202 Problems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 204 15 Electrostatics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 207 15.1 Poisson Equation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 207 15.1.1 Homogeneous Dielectric Medium . . . . . . . . . . . . . . . . . . 207 15.1.2 Charged Sphere . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 209 15.1.3 Variable ε . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 210 15.1.4 Discontinuous ε . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 211 15.1.5 Solvation Energy of a Charged Sphere . . . . . . . . . . . . . . 211 15.1.6 The Shifted Grid Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 213 15.2 Poisson Boltzmann Equation for an Electrolyte . . . . . . . . . . . . . . . . 215 15.2.1 Discretization of the Linearized Poisson–Boltzmann Equation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 216 15.3 Boundary Element Method for the Poisson Equation . . . . . . . . . . . 216 15.3.1 Integral Equations for the Potential . . . . . . . . . . . . . . . . . 217 15.3.2 Calculation of the Boundary Potential . . . . . . . . . . . . . . . 219 xiv Contents 15.4 Boundary Element Method for the Linearized Poisson– Boltzmann Equation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 222 15.5 Electrostatic Interaction Energy (Onsager Model) . . . . . . . . . . . . . . 223 15.5.1 Example: Point Charge in a Spherical Cavity . . . . . . . . . 225 Problems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 225 16 Waves . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 229 16.1 One-Dimensional Waves . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 229 16.2 Discretization of the Wave Equation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 231 16.3 Boundary Values . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 232 16.4 The Wave Equation as an Eigenvalue Problem . . . . . . . . . . . . . . . . 233 16.4.1 Eigenfunction Expansion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 233 16.4.2 Application to the Discrete One-Dimensional Wave Equation. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 234 16.5 Numerical Integration of the Wave Equation . . . . . . . . . . . . . . . . . . 237 16.5.1 Simple Algorithm . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 237 16.5.2 Stability Analysis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 238 16.5.3 Alternative Algorithm with Explicit Velocities . . . . . . . . 240 16.5.4 Stability Analysis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 240 Problems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 242 17 Diffusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 243 17.1 Basic Physics of Diffusion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 243 17.2 Boundary Conditions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 244 17.3 Numerical Integration of the Diffusion Equation . . . . . . . . . . . . . . . 245 17.3.1 Forward Euler or Explicit Richardson Method . . . . . . . . 245 17.3.2 Stability Analysis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 245 17.3.3 Implicit Backward Euler Algorithm . . . . . . . . . . . . . . . . . 247 17.3.4 Crank–Nicolson Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 248 17.3.5 Error Order Analysis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 249 17.3.6 Practical Considerations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 250 17.3.7 Split Operator Method for d > 1 Dimensions . . . . . . . . 250 Problems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 252 18 Nonlinear Systems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 253 18.1 Iterated Functions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 253 18.1.1 Fixed Points and Stability . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 254 18.1.2 The Ljapunow Exponent . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 256 18.1.3 The Logistic Map . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 257 18.1.4 Fixed Points of the Logistic Map . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 258 18.1.5 Bifurcation Diagram . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 259 18.2 Population Dynamics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 260 18.2.1 Equilibria and Stability . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 260 18.2.2 The Continuous Logistic Model . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 262 Contents xv 18.3 Lotka–Volterra model . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 262 18.3.1 Stability Analysis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 263 18.4 Functional Response . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 265 18.4.1 Holling–Tanner Model . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 266 18.5 Reaction–Diffusion Systems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 269 18.5.1 General Properties of Reaction–Diffusion Systems . . . . 269 18.5.2 Chemical Reactions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 270 18.5.3 Diffusive Population Dynamics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 270 18.5.4 Stability Analysis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 270 18.5.5 Lotka–Volterra Model with Diffusion . . . . . . . . . . . . . . . 272 Problems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 273 19 Simple Quantum Systems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 277 19.1 Quantum Particle in a Potential Well . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 278 19.2 Expansion in a Finite Basis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 282 19.3 Time-Independent Problems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 284 19.3.1 Simple Two-Level System . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 285 19.3.2 Three-State Model (Superexchange) . . . . . . . . . . . . . . . . 286 19.3.3 Ladder Model for Exponential Decay . . . . . . . . . . . . . . . 290 19.4 Time-Dependent Models . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 292 19.4.1 Landau–Zener Model. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 293 19.4.2 Two-State System with Time-Dependent Perturbation . 293 19.5 Description of a Two-State System with the Density Matrix Formalism . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 297 19.5.1 Density Matrix Formalism . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 297 19.5.2 Analogy to Nuclear MagneticResonance. . . . . . . . . . . . . 300 19.5.3 Relaxation Processes—Bloch Equations . . . . . . . . . . . . . 302 Problems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 307 Appendix. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 309 References . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 311 Index . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 315 |
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