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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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赵?V

新虫 (初入文坛)

[交流] 测序问题 已有1人参与

刚刚找测序公司做的DGGE的条带的测序结果出来了,可是每个条带有三个abi和三个seq文件,说是选择了三个克隆测序的结果,那个请问做blast时应该怎么做啊?选择其中的一个还是综合三个?第一次做测序完全不懂啊!
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biolinker

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个主要是拿seq文件的序列去进行blast比对,你做了三个克隆子,三个都要分析,如果三个菌都是一样的,说明这个条带就是这种菌,如果说3个克隆子都不一样的,选择相似度最高的一个,最后根据你比对出来的菌属信息做系统发育树。
2楼2015-03-19 09:55:28
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