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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 测序问题
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赵?V

新虫 (初入文坛)

[交流] 测序问题 已有1人参与

刚刚找测序公司做的DGGE的条带的测序结果出来了，可是每个条带有三个abi和三个seq文件，说是选择了三个克隆测序的结果，那个请问做blast时应该怎么做啊？选择其中的一个还是综合三个？第一次做测序完全不懂啊！
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1楼 2015-03-19 08:38:33
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biolinker

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
这个主要是拿seq文件的序列去进行blast比对，你做了三个克隆子，三个都要分析，如果三个菌都是一样的，说明这个条带就是这种菌，如果说3个克隆子都不一样的，选择相似度最高的一个，最后根据你比对出来的菌属信息做系统发育树。
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2楼2015-03-19 09:55:28
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