24小时热门版块排行榜    

查看: 284  |  回复: 1

赵?V

新虫 (初入文坛)

[交流] 测序问题 已有1人参与

刚刚找测序公司做的DGGE的条带的测序结果出来了,可是每个条带有三个abi和三个seq文件,说是选择了三个克隆测序的结果,那个请问做blast时应该怎么做啊?选择其中的一个还是综合三个?第一次做测序完全不懂啊!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

biolinker

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个主要是拿seq文件的序列去进行blast比对,你做了三个克隆子,三个都要分析,如果三个菌都是一样的,说明这个条带就是这种菌,如果说3个克隆子都不一样的,选择相似度最高的一个,最后根据你比对出来的菌属信息做系统发育树。
2楼2015-03-19 09:55:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 赵?V 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见