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flora5729

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助如何分析非同义SNP

老师给了一个课题,只说让我们分析千人基因组中的非同义SNP,说是最好和肝癌有关的,现在手上有部分数据,但是不知道怎么分析。。。
首先怎么解决判断一个SNP在不在编码区的问题呢。。。
其次找到了一个叫vcftool的工具,感觉可以使用其中的filter ,但是不知道过滤的区间段?
VCFtool使用方法

先谢谢大家,真的是新手不知道怎么办才好了。。。
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