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spring965

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】静电势计算

哪位高手知道静电势计算需要哪些关键词,不知道我的计算过程错在哪了,


下面是输入和输出文件,哪位高手给分析分析。

chk=Gfcube                              
#p  b3lyp/3-21g  5d cube=(potential,read)  
                                          
opt                                       
                                          
-1 1  

输出
Writing cube to file .                        
End of file reading cube parameters.           
Error termination via Lnk1e in C:\G03W\l602.exe
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wxjbuilder

木虫 (知名作家)

★ ★ ★
小红豆(金币+3,VIP+0):辛苦了。
看样子好像是:
%chk=Gfcube.chk                              
#p  b3lyp/3-21g  5d cube=(potential) Guess=Read Geom=Check  
                                          
opt                                       
                                          
-1 1
不知你的Gfcube是不是chk文件?
悠悠天地,奈何独立苍茫?
2楼2008-06-20 17:31:30
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spring965

金虫 (正式写手)

%chk=Gfcube.chk                              
#p  b3lyp/3-21g  5d cube=(potential)
                                          
cube                                       
                                          
-1 1
6             0        0.000000    0.682382    0.000000
6             0        0.702701   -0.724862    0.000000
7             0       -0.204764   -1.895182    0.000000
8             0        0.782573    1.663192    0.000000
8             0       -1.261098    0.650934    0.000000
1             0        1.363720   -0.790337    0.876813
1             0        1.363720   -0.790337   -0.876813
1             0       -0.841049   -1.705586   -0.780125
1             0       -0.841049   -1.705586    0.780125

但是还是报错

您看有时间在帮忙看看
3楼2008-06-20 22:20:28
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ferlich

禁虫 (小有名气)


小红豆(金币+1,VIP+0):辛苦了。
本帖内容被屏蔽

4楼2008-06-20 22:36:53
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spring965

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
小红豆(金币+3,VIP+0):辛苦了。
先使用formchk工具生成格式化的fchk

formchk jobname.chk jobname.fchk

这一步如何做到?

再用cubegen生成cub文件

cubegen 0 potential=scf jobname.fchk test.cube 80

这一步如何做到?

cubegen 0 potential=scf jobname.fchk test.cube 80 }是什么意思?

请不吝赐教
5楼2008-06-20 22:52:23
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spring965

金虫 (正式写手)

是不是无论是opt还是freq还是其它的计算得到的*.chk文件,只要scratch目录下有*.chk文件,都可以在view中得到分子的静电势呢?
6楼2008-06-20 22:59:39
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北京一叶567

木虫 (小有名气)


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 十大“耐思”版主评选欢迎参与投票 http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=845527&fpage=1
不是的。只有与静电势相关的计算,最后才能通过chk生成cub文件。如mk等。
7楼2008-06-21 00:03:23
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spring965

金虫 (正式写手)

%chk=Gfcube.chk                              
#p  b3lyp/3-21g  5d cube=(potential)
                                          
cube                                       
                                          
-1 1
6             0        0.000000    0.682382    0.000000
6             0        0.702701   -0.724862    0.000000
7             0       -0.204764   -1.895182    0.000000
8             0        0.782573    1.663192    0.000000
8             0       -1.261098    0.650934    0.000000
1             0        1.363720   -0.790337    0.876813
1             0        1.363720   -0.790337   -0.876813
1             0       -0.841049   -1.705586   -0.780125
1             0       -0.841049   -1.705586    0.780125

这个输入文件到底错在哪里了,正确的应该如何输入?
8楼2008-06-21 08:13:25
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spring965

金虫 (正式写手)

这个体系很小,2分钟就出错
602死掉,报错信息

                Electrostatic Grid Calculations

--------------------------------------------------------------
Grid  1 is a regular grid
Map a grid with origin  -3.891498 -4.796782 -3.446400
    Take  80 steps of     0.100723  0.000000  0.000000
    Take  90 steps of     0.000000  0.100723  0.000000
    Take  68 steps of     0.000000  0.000000  0.100723
Compute potential derivative range 0 to 0 and Write to file
9楼2008-06-21 09:25:49
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wxjbuilder

木虫 (知名作家)

★ ★ ★ ★
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢
你的那个chk我以为是已经算出来的呢,我是想通过调用chk文件直接生成out文件,
不过好像你不该取过来坐标,应该是Guess=Read,Geom=Check试试
当然,你也可以试试用二楼的方法试试,那个肯定对。在windows下的时候,要在MSDOS中运行cubugen操作
当然也可以这样算

%chk=name.chk                              
#p  b3lyp/3-21g   cube=potential test
                                          
cube                                       
                                          
-1 1
6             0        0.000000    0.682382    0.000000
6             0        0.702701   -0.724862    0.000000
7             0       -0.204764   -1.895182    0.000000
8             0        0.782573    1.663192    0.000000
8             0       -1.261098    0.650934    0.000000
1             0        1.363720   -0.790337    0.876813
1             0        1.363720   -0.790337   -0.876813
1             0       -0.841049   -1.705586   -0.780125
1             0       -0.841049   -1.705586    0.780125

eof
我换了一个例子试了一下,可以算的
悠悠天地,奈何独立苍茫?
10楼2008-06-21 17:52:56
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