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bbslover

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】毕业答辩,请教有关comfa的几个问题。

1.进行comfa时候,为什么选择小分子的最低能量构象,该构象不一定是分子的药物构象啊?是不是通过对接的方法确定构象最好。

2.为什么分子能量最小化的时候,先用分子立场优化,再用量子化学的方法优化,优化后是不是分子的能量达到最低?

3.用am1  pm3  mndo 优化有什么区别吗?

4.为什么要把分子叠加呢?不叠加不也能预测计算活性吗?


5.为什么要加电荷呢?

我估计明天老师要问我的,希望各位帮帮忙,也希望前辈们,给提出点问题,做comfa的原理是什么?

谢谢了。
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ky96998

金虫 (小有名气)


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
你问的这些问题都能从查阅文献来解决。
做毕业论文不是敷衍了事,今年我带的三个学生做CoMFA毕业论文已经答辩通过了,你提的问题他们都通过查阅文献理解了。临时抱佛脚可能来不及了哦!!
2楼2008-06-19 02:17:33
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
第一个问题,我想,是没有确定答案的。这也是 CoMFA 的一个弱项。
3楼2008-06-19 07:45:13
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bbslover

金虫 (正式写手)

呵呵,还是谢谢大家的帮助,答辩通过了。
4楼2008-06-19 13:40:40
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