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tudou10000

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】如何在material studio中模拟大分子的构象阿?

想用material studio模拟聚(甲基丙烯酸丁酯-丙烯腈)大分子,但画好的分子链都是直链,怎么才能将此大分子链的构象模拟出来呢?
请大家指导下吧!感激不尽啊!
[search]如何在material studio中模拟大分子?[/search]

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-26 at 16:26 ]
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csfn

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★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
引用回帖:
Originally posted by tudou10000 at 2008-6-17 17:04:
想用material studio模拟聚(甲基丙烯酸丁酯-丙烯腈)大分子,但画好的分子链都是直链,怎么才能将此大分子链的构象模拟出来呢?
请大家指导下吧!感激不尽啊!
[search]如何在material studio中模拟大分子?[/ ...

不大理解你的分子结构怎么样的

ms是比较搭建模型的工具,一般应该冒问题的。你用鼠标选中某些原子,然后按住击鼠标的滑轮就可以拖动某些原子,需要什么形状都可以
2楼2008-06-17 18:02:25
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tudou10000

木虫 (正式写手)

我是相比较均聚物与共聚物大分子链没有外力的情况下的伸直情况变化,是指通过力场计算后得到的分子构象。
不知道我这样得描述清不清楚,大家帮帮忙吧!
3楼2008-06-18 08:45:03
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tudou10000

木虫 (正式写手)

还有,我的大分子是通过部build工具建立的无规共聚物。
4楼2008-06-18 08:47:03
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csfn

荣誉版主 (知名作家)

优秀超版优秀版主优秀区长

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢建议
哦,你是要模拟这个变化情况是吧,不是要建立这样的结构~~~~

模拟的这样的情况,dft貌似是不大合适的,好像ms下面有做力场模拟的,不晓得是否可行,可读下help
5楼2008-06-18 09:01:36
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daniel2001

铜虫 (小有名气)


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 十大“耐思”版主评选欢迎参与投票 http://edu.emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=845527&fpage=1
把分子导入Amorphous Cell这样就可以计算他的构型了
6楼2008-06-18 17:36:44
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笑问天

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 十大“耐思”版主评选欢迎参与投票 http://edu.emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=845527&fpage=1
楼主画出来的都是直链,是因为软件本身默认单体之间的torsion角为180度,你可以仔细调整torsion角,并选择好是等规,间规还是无规;应当是能够画出任意构象的高分子链的。另外,如果要模拟高分子链构象,建议采用分子动力学方法,MS中的discover和forcite模块都能胜任。还可以参考杨小震的《分子模拟与高分子材料》这本书。
7楼2008-06-19 22:47:45
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tudou10000

木虫 (正式写手)

无比感谢各位的帮助!又不懂再请教各位哦!
8楼2008-06-20 08:26:56
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tudou10000

木虫 (正式写手)

各位,用MS软件的Amorphous cel模块construction操作到70%时显示任务失败,这一般可能是什么原因造成的呢?谢谢
9楼2008-07-24 12:24:01
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leerien

金虫 (初入文坛)

先试试看添加的组分链数减小看看行不?
10楼2008-07-24 16:32:27
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