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wubingran

金虫 (正式写手)

[求助] 相关性分析--结合位点

请教一个问题~~欢迎讨论
通过chip-seq分别找到三个转录因子在基因组上的结合位点,
文件1,A转录因子,在基因组上的结合位点
文件2,B转录因子,在基因组上的结合位点
文件3,C转录因子,在基因组上的结合位点
文件格式如下:
chr  from to
1     2000  2300
1     2389  2420
....

现在想知道,通过这三个转录因子在基因组上的结合位点,研究其overlap是否达到了显著水平,进而推导这三个转录因子(或其中两个)是不是有可能互作。
问题来了,统计学上,应该怎么来处理?
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