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子非鱼不知鱼

银虫 (初入文坛)

[求助] 如何预测植物病毒外壳蛋白的抗原表位

最近老师让做一个课题是先要找到植物病毒外壳蛋白上的抗原表位然后克隆表达,但是我查资料以后还是有很多东西不懂,希望大家能帮助我
1.做抗原表位预测好像很多方法是B细胞抗原表位预测及T细胞抗原表位预测,但是我不懂植物应该没有B和T细胞吧,那做这个预测是不是没有用呢?
2.那植物病毒的抗原表位预测用什么方法或者软件比较好?或者说,怎么找到抗原性较强的肽段?
3.我查找资料发现,不管做抗血清的制备或者抗病毒转基因植物都用的是整个外壳蛋白做克隆表达,所以我不清楚,老师让我找到抗原性比较强的肽段有必要吗?或者是有其他用途吗?
4.植物病毒用原核表达系统还是用真核表达系统有区别吗?我看文献上大多用原核表达,但是我怎么觉得用真核好一点,毕竟病毒是作用植物上啊
5.因为实验室没有提纯的病毒,也就木有模板做PCR扩增,那我要人工合成这段序列是不是非常难和麻烦?请问有哪位有方案可以参考一下吗?
本人比较小白,麻烦大家了,金币我会尽量送的
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虎头虎尾

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

ji yin he cheng hen fang bian

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2015-02-15 21:15:25
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虎头虎尾

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

yuan he biao da fang bian , xian xian kang yuan biao wei shi he yong

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2015-02-15 21:18:18
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子非鱼不知鱼

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 虎头虎尾 at 2015-02-15 21:18:18
yuan he biao da fang bian , xian xian kang yuan biao wei shi he yong

后面一句没看懂
4楼2015-02-15 21:23:28
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子非鱼不知鱼

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 虎头虎尾 at 2015-02-15 21:18:18
yuan he biao da fang bian , xian xian kang yuan biao wei shi he yong

学长,能详细说说吗?
5楼2015-02-16 10:19:13
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九字江山

银虫 (小有名气)


【答案】应助回帖

为了获取识别天然蛋白的抗体,有两种方式可以选择。一种是利用重组蛋白的方式获取尽可能接近天然条件下的重组蛋白,然后刺激试验动物免疫系统,进而获取相应抗体。这种方式获取抗体的成功率较高且效价较好;另一种是预测天然蛋白的抗原决定簇,这种抗原决定簇最终体现为多肽形式,将其与相应的载体偶联后刺激试验动物免疫系统,也可以获取相应的抗体。
资料网址:http://www.detaibio.com/peptide-antigen-prediction.html
6楼2015-02-28 09:29:58
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