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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】一端封闭的碳纳米管如何建立谢谢！！！
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siuchun

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】一端封闭的碳纳米管如何建立谢谢！！！

如题,多谢!

建立后可以得出每个碳原子的坐标值吗?

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-26 at 16:46 ]
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1楼 2008-06-12 18:23:18
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lxmn

木虫 (小有名气)
★ ★
小红豆(金币+2,VIP+0):谢谢！
引用回帖:
Originally posted by siuchun at 2008-6-12 18:23:
如题,多谢!

建立后可以得出每个碳原子的坐标值吗?

呵呵，正好我前俩天摸索了建立了一个。
我是这样建立的
1。首先选择一个纳米管，我选的是[5，5]的，然后在选择一个足球烯。
2。把足球烯删掉一半，把剩下的一半拷贝到纳米管里面。移动一半的足球烯到合适的位置，适量增减碳原子数目，到你感觉良好为止。
3。clean一下，他们就结在一起了。除了clean外也可以直接进行简单优化。就成一端封闭的了
4。输出成mol形式，可以在gview里面打开成你想要的形式。
5。可以自己写坐标，也可能有其他的软件更简单，呵呵。
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2楼2008-06-12 18:40:14
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siuchun

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by lxmn at 2008-6-12 18:40:


呵呵，正好我前俩天摸索了建立了一个。
我是这样建立的
1。首先选择一个纳米管，我选的是[5，5]的，然后在选择一个足球烯。
2。把足球烯删掉一半，把剩下的一半拷贝到纳米管里面。移动一半的足球烯到合适 ...

多谢! 请问gview是另外要下载的软件吗? 我主要是想得到封闭碳纳米管中各个碳原子的坐标值数据
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3楼2008-06-12 19:03:03
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panda_wendao

金虫 (小有名气)
★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与，化学区正在举办十大“耐思”版主评选，http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=845527，欢迎你去投票支持计模版版主！
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4楼2008-06-12 20:25:44
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acridine

木虫 (正式写手)
★
spur(金币+1,VIP+0):3Q!
引用回帖:
Originally posted by siuchun at 2008-6-12 19:03:



多谢! 请问gview是另外要下载的软件吗? 我主要是想得到封闭碳纳米管中各个碳原子的坐标值数据

存成.pdb 再用记事本打开
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5楼2008-06-12 22:26:51
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siuchun

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by panda_wendao at 2008-6-12 20:25:
http://www.math.uni-bielefeld.de/~CaGe/
试试这个软件。

多谢，这个软件我也看到过，但现在好像还没windows版本的
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6楼2008-06-13 09:56:54
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Eileen7600

捐助贵宾 (小有名气)

worker
引用回帖:
Originally posted by lxmn at 2008-6-12 18:40:


呵呵，正好我前俩天摸索了建立了一个。
我是这样建立的
1。首先选择一个纳米管，我选的是[5，5]的，然后在选择一个足球烯。
2。把足球烯删掉一半，把剩下的一半拷贝到纳米管里面。移动一半的足球烯到合适 ...

怎么固定【5，5】管，移动C60呢？希望指教，谢谢
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Workerwillbecomeboss,Ibelieve!
7楼2008-06-26 18:14:11
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