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yiding08

新虫 (初入文坛)

[求助] MS并行计算求助 已有2人参与

最近一直在研究如何在集群上安装MS,并实现跨节点的并行计算,我们的集群每个节点是8个核,我暂时连接了两个节点,共16个核,提交一个16核任务是没有问题的,但是先提交一个8核的任务,然后再提交一个8核的,第二次提交的不会提交到第二个节点上,而是在第一个节点上,然后top命令显示有16个进程,每个占cpu50%左右,这是什么原因呢?可不可以让后来提交的任务不再占用已经提交任务的资源呢。我是通过windows下的MS往集群上提交的任务。本人新手,还请大家多多指教。
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

★ ★ ★
yiding08(ljw4010代发): 金币+3, 谢谢指导解答! 2015-03-11 20:41:04
这个状况可通过手工在machine.linux文件做修改,每次提交前做修改即可。

节点多的话建议安装作业调度,MS能够支持的开源作业调度只有Torque,但是我自己测试下来没成功,也可以通过其他的PBS在命令行调度,但相对麻烦,所以我们组内部的小集群(只有4节点)只是通过修改machine.linux文件。

如果真的是超线程导致,8cpu对于16线程的任务每个的显示是100%,或是8线程的任务cpu总占用是50%,如果你还不放心可以top命令下按1,看看每个cpu是否是100%。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
11楼2015-02-25 00:48:25
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rx93hughes

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-02-09 07:49:22
你的cpu是intel还是amd
intel的话去bios关掉超线程(Hyper-Threading),我估计你交16核心的任务node2也没运行,因为HT开了之后8核会虚拟成16核,也可以用pbsnodes命令查看单个节点可用核心数判断。
如果是amd就当我没说吧
2楼2015-02-08 23:34:54
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yiding08

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by rx93hughes at 2015-02-08 23:34:54
你的cpu是intel还是amd
intel的话去bios关掉超线程(Hyper-Threading),我估计你交16核心的任务node2也没运行,因为HT开了之后8核会虚拟成16核,也可以用pbsnodes命令查看单个节点可用核心数判断。
如果是amd就当 ...

多谢回复。
是intel的,提交16核心任务的时候,两个节点上cpu和内存都是有占用的,应该是运行的。没有开超线程。
3楼2015-02-09 09:11:34
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yiding08

新虫 (初入文坛)

昨晚通过更改machines.LINUX文件里面的内容,把两个节点顺序颠倒过来,再提交一个8核任务,就可以提交到另一个节点了,大家有没有别的办法啊,这种操作也太不智能了。
4楼2015-02-09 09:19:05
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