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perseusrz

金虫 (初入文坛)

[交流] PyMol软件怎么将蛋白质空间结构中选中的3个氨基酸残基的电荷量计算出来? 已有1人参与

用了Wizard里面的Charge没用啊都只显示0.00000
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perseusrz

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wbf3ng at 2015-02-04 00:05:56
apbs,应该用这个计算,然后才能显示的吧,巧妇难为无米之炊

计算出来的这些怎么看哪个是电荷啊?
ATOM   3334  N   ASP   226      62.256 -20.499  35.877 -0.4000 1.5000
ATOM   3335  CA  ASP   226      61.819 -19.294  36.558 -0.0000 2.0000
ATOM   3336  C   ASP   226      62.385 -19.299  37.976  0.5500 1.7000
ATOM   3337  O   ASP   226      61.723 -19.704  38.960 -0.5500 1.4000
ATOM   3338  CB  ASP   226      60.283 -19.198  36.544  0.0000 2.0000
ATOM   3339  CG  ASP   226      59.768 -17.891  37.133  0.1000 1.7000
ATOM   3340  OD1 ASP   226      60.485 -16.858  37.032 -0.5500 1.4000
ATOM   3341  OD2 ASP   226      58.648 -17.907  37.702 -0.5500 1.4000
ATOM   3342  H   ASP   226      62.192 -21.457  36.308  0.4000 1.0000
ATOM   3343  HA  ASP   226      62.228 -18.515  36.085  0.0000 0.0000
ATOM   3344  HB3 ASP   226      59.925 -19.952  37.079  0.0000 0.0000
ATOM   3345  HB2 ASP   226      59.982 -19.263  35.601  0.0000 0.0000
3楼2015-02-04 21:46:01
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查看全部 3 个回答

wbf3ng

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
abinitio: 金币+2, 鼓励交流 2015-02-04 23:15:57
apbs,应该用这个计算,然后才能显示的吧,巧妇难为无米之炊

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2015-02-04 00:05:56
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