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lmxue

铜虫 (小有名气)

[交流] 怎样计算Gaussian软件不自带的溶剂效应呢

我用PCM模型,需要溶剂半径吗,我想算得是二氧杂环乙烷,不知溶剂半径是多少
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wxjbuilder

木虫 (知名作家)


小红豆(金币+1,VIP+0):xinku.
用关键词Volume算一下,具体看一下高斯手册
悠悠天地,奈何独立苍茫?
3楼2008-06-23 18:24:11
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xieqingsky

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by wxjbuilder at 2008-6-23 18:24:
用关键词Volume算一下,具体看一下高斯手册

Volume算的溶剂半径一般都是推荐用于onsager模型算的溶质半径,好像是经过溶剂化处理的啊
4楼2008-07-09 20:36:11
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blackwind

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
zzgyb(金币+3,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎继续关注计算模拟版!
lmxue(金币+1,VIP+0):thank you 3-30 22:01
我在其它地方发现的答案,摘抄过来
问题如下:
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------

溶剂化效应的问题.
一般计算体系的溶剂化效应时,如使用的溶剂在Gaussian里有的话,命令行里输入:rb3lyp/6-311g scrf=(pcm,solvent=.........),一般可以完成. 但如使用的溶剂在Gaussian没有的话,那么做溶剂化效应.  PLZ说说怎么输?
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------
答案如下
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------
try this:
%Chk=unstandard.chk
#b3lyp/6-311g scrf=(PCM,read)

titile

0 1
geometry input

EPS=37.5  (this is dielectric constant of the solvent you will use)
RSOLV=3.49 ( this is solvent radius in Angstroms)
TABS=300.0 (temperature)
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------
关键就是后面几行,希望能对你有帮助
5楼2008-07-24 16:44:19
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majun04

木虫 (著名写手)

majun

★ ★ ★ ★
zzgyb(金币+3,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
lmxue(金币+1,VIP+0):谢谢 7-29 12:37
引用回帖:
Originally posted by lmxue at 2008-6-9 09:51:
我用PCM模型,需要溶剂半径吗,我想算得是二氧杂环乙烷,不知溶剂半径是多少

我用的是SCRF=IEFPCM,需要参数溶剂的介电常数,溶剂分子的半径,溶剂的密度。
溶剂的介电常数和密度取自兰氏化学手册,溶剂半径的计算得到。具体方法如下:
1。对DMF气相分子全优化。
2。计算DMF的半径,得到参数。
3。在DMF(溶剂)中对丙二醇进行结构全优化。
仅供参考,如果有错,请高手指导。
乐观、执着、勤奋
6楼2008-07-25 16:00:43
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