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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 登录号KM588379，怎样查找它的蛋白质序列，准备做蛋白质序列分析
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ZYY小丸子

新虫 (初入文坛)

[求助] 登录号KM588379，怎样查找它的蛋白质序列，准备做蛋白质序列分析 已有4人参与

准备做蛋白质序列分析，用NCBI选了protein输入登录号出来的是这种序列，用SOPMA和  PHYRE2分析都说不是氨基酸序列，请好心人帮忙找出这个登录号的蛋白序列。
        1 atgggaagac ctccttgctg tgataaatta gggttgaaga aaggtccatg ggcgcctgaa
       61 gaagatattc ttctggtttc ttatattcaa gaacatggcc ctggaaattg gcgagccgtt
      121 cctactaaca ctggactgat gagatgcagt aagagttgca ggctgagatg gactaattat
      181 ctcaggccag gaattaagcg tggtaatttc actgagcaag aagagaagat gatcattcat
      241 ctccaagccc ttctcggcaa tcgatgggca gccatagctt catatctacc acaacgcacc
      301 gacaacgaca tcaagaacta ctggaacacc cacttgaaga agaagctgag caagttacaa
      361 ggaaatggag aagaagggca tgttggtaat ttccaagaag atgacttttc gtctgcatct
      421 tcttctcaat ctaaccatca gtcaagcaac aaaggacagt gggaaagacg gcttcaaact
      481 gatatccaca ccgccaaaca agccttatgt gatgctcttt ctctagacaa acctccggtc
      541 actgccgaat ttccggtaaa accgtcaaac caaacaagcc cttatgcctt gagcgcagac
      601 aacatcgcta agctactgga gaactggacc accgttaaaa agccggttgg aaccggatcc
      661 ggttcaagct cgagtgaggg tgagtattcg agatttagaa gcttcaattc agcatcagct
      721 gccacgtcag acgagcaatc agatgacacg ttgtacacta ccgctaagca agaggagggt
      781 ggcccacttt tcttgcttga gaaatggttg tttgaagatc agactggact gcttgttgat
      841 atgccttatg ccgccgccgc cgatgatctg ttctaa
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为毕业论文再奋斗几天
1楼 2015-01-28 15:38:49
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晞朔

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KM588379
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2楼2015-01-28 16:27:17
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ZYY小丸子

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 晞朔 at 2015-01-28 16:27:17
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KM588379

/translation="MGRPPCCDKLGLKKGPWAPEEDILLVSYIQEHGPGNWRAVPTNT
                     GLMRCSKSCRLRWTNYLRPGIKRGNFTEQEEKMIIHLQALLGNRWAAIASYLPQRTDN
                     DIKNYWNTHLKKKLSKLQGNGEEGHVGNFQEDDFSSASSSQSNHQSSNKGQWERRLQT
                     DIHTAKQALCDALSLDKPPVTAEFPVKPSNQTSPYALSADNIAKLLENWTTVKKPVGT
                     GSGSSSSEGEYSRFRSFNSASAATSDEQSDDTLYTTAKQEEGGPLFLLEKWLFEDQTG
                     LLVDMPYAAAADDLF"
是这个吧，把这个粘贴至SOPMA需要修改格式吗，全部都铺满，不留空隙？
登录号KM588379，怎样查找它的蛋白质序列，准备做蛋白质序列分析
2.jpg
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为毕业论文再奋斗几天
3楼2015-01-28 17:48:33
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晞朔

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by ZYY小丸子 at 2015-01-28 17:48:33
/translation="MGRPPCCDKLGLKKGPWAPEEDILLVSYIQEHGPGNWRAVPTNT
                     GLMRCSKSCRLRWTNYLRPGIKRGNFTEQEEKMIIHLQALLGNRWAAIASYLPQRTDN
                     DIKNYWNTHLKKKLSKLQGNGEEGHVGNFQE ...

从M开始，到F结束啊。完整的蛋白序列吧
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4楼2015-01-28 20:07:25
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zshw_001

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
一般的功能基因，NCBI上都直接列出了蛋白序列，可以直接用啊。
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永远相信未知的总是美好的！
5楼2015-01-28 21:02:44
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飞约疯人院

专家顾问 (著名写手)

科学怪人

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
ORIGIN      
        1 mgrppccdkl glkkgpwape edillvsyiq ehgpgnwrav ptntglmrcs kscrlrwtny
       61 lrpgikrgnf teqeekmiih lqallgnrwa aiasylpqrt dndiknywnt hlkkklsklq
      121 gngeeghvgn fqeddfssas ssqsnhqssn kgqwerrlqt dihtakqalc dalsldkppv
      181 taefpvkpsn qtspyalsad niakllenwt tvkkpvgtgs gssssegeys rfrsfnsasa
      241 atsdeqsddt lyttakqeeg gplfllekwl fedqtgllvd mpyaaaaddl f
//
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人生贵在行动，迟疑不决时，不妨先迈出小小一步。
6楼2015-01-28 21:14:49
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红卫大兵

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
ncbi上面很多功能，你肯定没好好看他的说明
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7楼2015-01-28 21:19:18
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