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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » [求助]如何修复氨基酸残基？
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

[交流] [求助]如何修复氨基酸残基？

如何修复氨基酸残基？
下载的PDB文件显示有氨基酸残基缺失，如何将其修复？
我怎么样知道哪个残基缺失？怎样操作将其修复？
谢谢！
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个人博客：[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
1楼 2008-06-06 22:08:39
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acdmail1

金虫 (小有名气)
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zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，化学区正在举办十大“耐思”版主评选，http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=845527，欢迎你去投票支持计模版版主！
tripos Sybyl 或者 Accelrys InsightII
请阅读相关的manual
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2楼2008-06-07 04:28:39
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长
那请问我如何知道是哪个残基有问题啊？谢谢指教啊！
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个人博客：[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
3楼2008-06-07 10:22:02
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xxffliu

铜虫 (小有名气)
★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，化学区正在举办十大“耐思”版主评选，http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=845527，欢迎你去投票支持计模版版主！
spdbv，读入后缺失的侧链用紫色标出。主链缺失很难做，因为本身就是因为晶体结构电子云密度低而导致无法解出，尤其是在loop区。
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4楼2008-06-12 19:16:01
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shenjjjj

新虫 (初入文坛)
pdb文件中也有信息的
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5楼2008-06-12 20:48:46
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长
那请问shenjjjj，PDB文件中的信息具体表现为何？
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个人博客：[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
6楼2008-06-13 08:59:25
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