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bao86

铁虫 (小有名气)

[交流] 求助关于NCBI比对

我16S RNA 到NCBI上比对。请问比对后显示结果时“ Max score ” “Total score ”“Query coverage” “ E value”  “Max ident ”具体代表什么意思啊
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献


lixiaoyi1981(金币+1,VIP+0):谢谢,顺便学习一下。
序列比对是根据具体的算法,实现打分。有匹配,错配,gap,按照不同分值赋分的。所以Max score:代表最高分。Query coverage:代表跟你所递交序列的覆盖率。E value:越小越好,就是跟买彩票一样的,越小证明你并非运气使得它们这么好的匹配,而是他们本身就很匹配。Max ident :表示最大相似程度。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
2楼2008-06-06 12:17:47
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bao86

铁虫 (小有名气)

知道了,谢谢哦
3楼2008-06-06 12:22:01
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