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shxincui518铜虫 (正式写手)
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[交流]
【求助】castep做电荷密度图的问题
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| 我用castep做出电荷密度来，想用黑白的衬底，但我看图像一点也不清晰，通过color mapping试着改了下，效果不是很好。想问问大家是如何处理这种电荷密度图的？ |
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acridine
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6楼2008-06-05 10:21:26
acridine
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记得以前在别的论坛发过帖子处理这个问题的，现在大概说一下吧 首先说一下哪些是我们自己能处理的：dmol和castep得到的电荷密度都可以自己处理。但是注意：castep的差分电荷是处理不了的，它的格式不是可读的。而通常的分析中，最重要的又恰恰是差分电荷，所以想处理差分电荷等高线的同志们还是去找一下lev00这个软件吧。 对于电荷密度，首先要找到数据存放的文件：打开结果所在文件夹，文件夹选项中显示隐藏文件，dmol的电荷密度计算结果文件是xxx_density.grd,而castep的结果文件是xxx.charg_frm （castep需要先分析->electron density-> save 才能找到这个文件） 之后就是处理这个文件了，你可以打开它，无论grd还是 frm格式，它里面都有一组数据，这就是空间网格点上各个点的电荷密度值，剩下的工作就是找到你需要的那个面上各个点的数据值，导出来，这需要编程序实现，如果你的面很普通，这会很复杂，如果是平行于坐标轴的面，找出数据点会适当简单一些. 找到点后就可以画图了，无论是用origin还是matlab都能实现。 最后说一下我自己的看法：对这种等高线图没有必要太深究，真的没必要。我当初费了好大劲编程虚实现了这个功能，但是现在看来并没有什么太大的实际价值，也基本没用过。现在无论分析数据还是写文章都用ms自带工具画的图。重要的是你的思想，至于图，只要能的表述清你的问题就可以，简单的用ms画的图就好了。 ps 在ms画图时在color map 上选择中几条线，就可以出现类似等高线的图，也可以作得很美观。 |
21楼2008-09-27 23:15:31