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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 专业学科区 » 农林 » 园艺 » 谁会设计EST-SSR引物？帮帮俺。
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titus0805

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
10楼: Originally posted by happydd点点 at 2015-01-22 08:42:57
额，有1351条EST，的确少，但应该也能设计吧。之前有篇文章是做的EST-SSR引物设计，但是只有摘要，没有全文，联系作者也没音讯。

1.png
...

我搜了一下，est数据库里面几乎找不到微卫星序列，非冗余核酸库里面倒是有，不过每种重复核心也就1、2条，可能不够你用的
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11楼2015-01-22 09:02:39
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happydd点点

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
11楼: Originally posted by titus0805 at 2015-01-22 09:02:39
我搜了一下，est数据库里面几乎找不到微卫星序列，非冗余核酸库里面倒是有，不过每种重复核心也就1、2条，可能不够你用的...

额。。。。。好惨。
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12楼2015-01-22 09:42:46
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titus0805

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
12楼: Originally posted by happydd点点 at 2015-01-22 09:42:46
额。。。。。好惨。...

你打算设计多少？预计成本有多少？
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13楼2015-01-22 09:45:20
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happydd点点

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
13楼: Originally posted by titus0805 at 2015-01-22 09:45:20
你打算设计多少？预计成本有多少？...

这么少能设计多少设计多少。如果多，先100左右吧。成本嘛，不知道。
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14楼2015-01-22 10:36:34
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happydd点点

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
13楼: Originally posted by titus0805 at 2015-01-22 09:45:20
你打算设计多少？预计成本有多少？...

图片2是2012年一篇文献，设计了7对。。。。。。很少。图片3是14年的文献，可惜只有摘要。没有序列，不能直接用。
谁会设计EST-SSR引物？帮帮俺。
2.png


谁会设计EST-SSR引物？帮帮俺。-1
3.png
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15楼2015-01-22 10:42:06
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titus0805

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
15楼: Originally posted by happydd点点 at 2015-01-22 10:42:06
图片2是2012年一篇文献，设计了7对。。。。。。很少。图片3是14年的文献，可惜只有摘要。没有序列，不能直接用。

2.png

3.png
...

第一篇文章，他说ssrit能检出六十多个ssr，那一定是参数调的非常宽松，不一定是真正的ssr，所以后面只验证出1条有多态的。
后面那个rna-seq就是我说的测转录组，你要是有本事把他们测的数据要过来你就不用测啦，可以直接用。
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16楼2015-01-22 11:12:34
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happydd点点

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
16楼: Originally posted by titus0805 at 2015-01-22 11:12:34
第一篇文章，他说ssrit能检出六十多个ssr，那一定是参数调的非常宽松，不一定是真正的ssr，所以后面只验证出1条有多态的。
后面那个rna-seq就是我说的测转录组，你要是有本事把他们测的数据要过来你就不用测啦，可 ...

嘿嘿，没本事。总想着他们赶紧发文章吧，发出来不就可以用了。
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17楼2015-01-22 14:16:48
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titus0805

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
17楼: Originally posted by happydd点点 at 2015-01-22 14:16:48
嘿嘿，没本事。总想着他们赶紧发文章吧，发出来不就可以用了。...

文章发出来，不一定公布引物序列
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18楼2015-01-22 14:29:15
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happydd点点

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
18楼: Originally posted by titus0805 at 2015-01-22 14:29:15
文章发出来，不一定公布引物序列...

啊，不能发出来共享共享嘛。哎，没劲
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19楼2015-01-23 09:32:14
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sunyanxi

禁虫 (初入文坛)
本帖内容被屏蔽
20楼2015-05-07 08:59:27
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