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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 如何判断一个化学键是否穿过一个苯环或者原子形成的其他环
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winnds

铁虫 (小有名气)

[求助] 如何判断一个化学键是否穿过一个苯环或者原子形成的其他环 已有1人参与

用程序生成键的时候需要判断新形成的键是否合理，不知道怎么来搞了，最好能给出实现的程序，给出思想也可以。先谢谢了
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啊哈哈哈哈哈哈哈哈哈
1楼 2015-01-17 06:06:25
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
引用回帖:
5楼: Originally posted by winnds at 2015-01-19 06:44:32
用ms集成的perl程序实现吧，麻烦你把你查到的数学算法发上来，让我参考着写一下，改成perl的程序吧，不胜感激...

你看看这个pl文件，涉及ringcheck，但是好像关键代码在其他library里 不知道你能不能看得懂
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  • 附件 1 : ac.pl
    • 2015-01-19 09:15:38, 17.72 K
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
6楼2015-01-19 09:14:02
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wbf3ng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
winnds(月只蓝代发): 金币+2, 鼓励交流 2015-01-17 16:47:12
把环定义为一个平面，产生的新的化学键为直线，如何判断一个直线是否通过一个平面且在某一范围内。

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2楼2015-01-17 15:15:30
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winnds

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wbf3ng at 2015-01-17 15:15:30
把环定义为一个平面，产生的新的化学键为直线，如何判断一个直线是否通过一个平面且在某一范围内。

你后面的问题也就是我想知道的，ms在生成AmorphousCell的时候有一个自己Configuration Settings就是CheckRingSpearing,但是这个只是一个隐含的选项，没有办法把它的判断结果调用出来，或者把它的方法调用出来啊
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啊哈哈哈哈哈哈哈哈哈
3楼2015-01-18 06:48:45
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wbf3ng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
winnds(月只蓝代发): 金币+1, 鼓励交流 2015-01-18 13:57:12
你是想怎么用？自己写程序实现？用什么语言，我觉得查查一些数学算法应该能很快写出来，关于判断一条直线是否在某个区域穿过一个平面。

[ 发自小木虫客户端 ]
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4楼2015-01-18 09:27:24
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