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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » NBO/AIM » NBO6.0
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yan505256466

铜虫 (初入文坛)

[求助] NBO6.0 已有1人参与

我算NBO6.0，每次没有算完就不动了，我是提交到服务器上算的，应该不会是内存问题，求助各位大神。这是最后几行，也没有提示出错，就是不算。
         -------------------------------
                 Total Lewis   49.32583  ( 95.8366%)
           Valence non-Lewis    1.99946  (  3.8848%)
           Rydberg non-Lewis    0.14338  (  0.2786%)
          -------------------------------
               Total unit  3   51.46867  (100.0000%)
              Charge unit  3   -0.46867


NATURAL RESONANCE THEORY ANALYSIS, alpha spin:

Maximum reference structures : 20
Maximum resonance structures : 300
Memory requirements : 24026556 words of 98684054 available

Significant Rydberg density detected by VALDM; consider using NRTFDM
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yan505256466

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1楼 2015-01-16 21:37:07
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wbf3ng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
yan505256466: 金币+10, ★★★很有帮助, 非常感谢，我试一下 2015-01-17 08:53:57
翻译我就不翻译了，在官方的FAQ的Q9就有说到这个问题。加个关键字就好。Q9. My NRT job goes into an infinite hang that requires killing the job. How can I recognize that the job is hung, and what can I do to prevent it?
The hang probably results from a case where apparent hypervalency was detected and the program attempted to restart NRT with the NRTFDM option using the full (rather than valence-only) density matrix, but without sufficient memory to accomodate necessary reference structures. (Look for the "apparent hypervalency" message near the bottom of the .LOG file to see if this type of hang is likely.) The solution is to provide LOTS of memory for possible hypervalent cases, and/or to include the NRTFDM keyword so that the full density matrix is used from the outset. In this case, inadequate memory will lead to an early abort, rather than an infinite hang.  

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2楼2015-01-17 07:20:30
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yan505256466

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wbf3ng at 2015-01-17 07:20:30
翻译我就不翻译了，在官方的FAQ的Q9就有说到这个问题。加个关键字就好。Q9. My NRT job goes into an infinite hang that requires killing the job. How can I recognize that the job is hung, and what can I do ...

您好，我加了NRTFDM关键词，直接提示出错，这是为什么呢？

QPErr --- A syntax error was detected in the input line.
#p m06l/gen pop=nbo6read nrtfdm
                          '
Last state= "GCL"
TCursr=      3523 LCursr=        25
Error termination via Lnk1e in /home/gauss/g09d01/g09/l1.exe at Sat Jan 17 08:50:50 2015.
Job cpu time:       0 days  0 hours  0 minutes  0.4 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      5 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1
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3楼2015-01-17 09:01:26
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wbf3ng

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by yan505256466 at 2015-01-17 09:01:26
您好，我加了NRTFDM关键词，直接提示出错，这是为什么呢？

QPErr --- A syntax error was detected in the input line.
#p m06l/gen pop=nbo6read nrtfdm
                          '
Last state= " ...

关键字不是放这里的，这关键字是nbo不是高斯的

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4楼2015-01-17 11:29:25
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yan505256466

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by wbf3ng at 2015-01-17 11:29:25
关键字不是放这里的，这关键字是nbo不是高斯的
...

我以前没算过，所以不太清楚诶，那请问一下关键词放在哪里呢？万分感谢。

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5楼2015-01-17 13:11:16
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wbf3ng

金虫 (小有名气)
gjf文件的最后

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6楼2015-01-17 15:16:48
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yan505256466

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by wbf3ng at 2015-01-17 15:16:48
gjf文件的最后

我的GJF文件的最后是这样的：$nbo nrt $end，中间那个是这个NRTFDM关键词吗？如果是的话那又会是什么问题呢。
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7楼2015-01-17 16:04:51
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wbf3ng

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by yan505256466 at 2015-01-17 16:04:51
我的GJF文件的最后是这样的：$nbo nrt $end，中间那个是这个NRTFDM关键词吗？如果是的话那又会是什么问题呢。...

是的，看着nbo手册写吧

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8楼2015-01-17 17:05:37
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yan505256466

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by wbf3ng at 2015-01-17 17:05:37
是的，看着nbo手册写吧
...

我仔细看了一下输出文件，它是已经算完了应该，只是到最后就不动了，对数据有影响吗？相同的体系，不同的物质，有的可以算完，有的却不可以。我没有NBO手册，不知道我的输入文件怎样修改才可以，麻烦您了，不知您那里有没有算例什么的，可供我参考学习的？万分感谢。

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9楼2015-01-17 22:48:20
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wbf3ng

金虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by yan505256466 at 2015-01-17 22:48:20
我仔细看了一下输出文件，它是已经算完了应该，只是到最后就不动了，对数据有影响吗？相同的体系，不同的物质，有的可以算完，有的却不可以。我没有NBO手册，不知道我的输入文件怎样修改才可以，麻烦您了，不知您那 ...

nbo手册在网上应该有，我是一直手机在线，所以没得看，以前下过一本电子版的手册，没在手机上。如果自己需要的数据都提取得到，也没什么了。

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10楼2015-01-17 23:24:53
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