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qll8384

新虫 (初入文坛)

[交流] PCR问题 已有3人参与

真菌基因组能够P出ITS序列,但是其余序列比如EF1-α,mtSSU等,都不能P出来?这是为啥呢?
有谁遇到过这样的事情?!
但是,有时候,重复相同的条件,相同的体系,尽然能出来一部分。
是在让人捉摸不透啊。
各位虫友,我们一般做25微升体系。EF1-α退火温度在53℃,时间是30s,有什么不妥的吗?
实验前期,P出来的相当顺利,后期,几乎不能出。
求原因。
谢谢大神哦
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kuaile5420

专家顾问 (著名写手)

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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-01-14 20:01:32
先缓一缓,分子实验就是这样,别担心,换个PCR体系试一试看看可以不哈,还有就是做PCR的体系是不是放置的时间长了,效果不好了,也可以拿个新的重复一下,祝你好运哈。
坚持到底就是胜利!
2楼2015-01-13 23:13:50
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18761615793

木虫 (正式写手)

小虫

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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-01-14 20:01:41
对的,分子实验就是这样,看不见摸不着的,有时候说明都是好的,就是不出来结果,呵呵。多做几次。
退火温度53℃30s,25微升的体系没有什么不妥。(退火温度要根据你的引物确定)

还有,你是扩增一个真菌基因组DNA上的多少个序列?一共设计了多少对引物呢?
扩增大于2个序列以上的话,要多重PCR,不然扩不出来的,希望对你有所帮助
todayisdifficult,tomorrowismoredifficult,butthedayaftertomorrowisbeautiful
3楼2015-01-14 09:42:32
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cosign

木虫 (正式写手)

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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-01-14 20:01:50
前期能P出来,现在P不出来了,估计是基因组出问题了,重新提一下基因组看看
4楼2015-01-14 16:35:05
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qll8384

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by cosign at 2015-01-14 16:35:05
前期能P出来,现在P不出来了,估计是基因组出问题了,重新提一下基因组看看

基因组的问题,我们已经重提过两次,但是还是一样的结果。不过最近有个事情,特别奇怪。实验室只有一个人能够P出来,其余的都表示很痛苦。这个着实解释不出来啊。我们用的药品,体系,PCR条件都一样。
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5楼2015-01-16 09:27:20
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qll8384

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by kuaile5420 at 2015-01-13 23:13:50
先缓一缓,分子实验就是这样,别担心,换个PCR体系试一试看看可以不哈,还有就是做PCR的体系是不是放置的时间长了,效果不好了,也可以拿个新的重复一下,祝你好运哈。

谢谢,我也是决定,暂停试验。回头重看吧。
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6楼2015-01-16 09:30:28
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qll8384

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 18761615793 at 2015-01-14 09:42:32
对的,分子实验就是这样,看不见摸不着的,有时候说明都是好的,就是不出来结果,呵呵。多做几次。
退火温度53℃30s,25微升的体系没有什么不妥。(退火温度要根据你的引物确定)

还有,你是扩增一个真菌基因组 ...

对了,你提到多重PCR,这个我也做了。但是我的序列是一条的。不过,这个确实出了几个条带。但是有些事非特异性的。在纯化上,个条带距离不是很大,亮度都差不都。所以就放弃了。谢谢你了
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7楼2015-01-16 09:32:14
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18761615793

木虫 (正式写手)

小虫


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引用回帖:
5楼: Originally posted by qll8384 at 2015-01-16 09:27:20
基因组的问题,我们已经重提过两次,但是还是一样的结果。不过最近有个事情,特别奇怪。实验室只有一个人能够P出来,其余的都表示很痛苦。这个着实解释不出来啊。我们用的药品,体系,PCR条件都一样。...

引物也是一样的?如果引物也是一样的话。。嘿嘿,那就先缓缓在做吧
todayisdifficult,tomorrowismoredifficult,butthedayaftertomorrowisbeautiful
8楼2015-01-16 09:40:40
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qll8384

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 18761615793 at 2015-01-16 09:40:40
引物也是一样的?如果引物也是一样的话。。嘿嘿,那就先缓缓在做吧...

引物却是一样,我估计是药品出问题了。
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9楼2015-01-16 10:15:48
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