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guxing.2010

铜虫 (初入文坛)

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[求助] 投稿有经验的虫友帮忙看看我该如何回复审稿人的问题。已有1人参与

小弟在frontiers in microbiology上投了一篇转录分析的文章，开始审稿人对我取样过程有疑问，我补上取样部分试验后。他又对我转录数据的生物学统计能否支持我的生物现象有疑问，再加上审稿人给我提的建议，我真是不知道如何回复了？

（转录分析找华大做的，编辑的建议虽好，但是我们实验室没有相关基础啊）

Q31.JPG

[ Last edited by guxing.2010 on 2015-1-14 at 22:38 ]

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1楼 2015-01-13 16:05:04

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

ssssllllnnnn

至尊木虫 (知名作家)

Translator and Proofreader

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【答案】应助回帖

我不知道你所说的转录数据具体是怎么做的，估计是microarray？严格说来叫转录数据不见得合适。Anyway，审稿人2显然对这一套本身也不是非常熟悉。当然他提出的问题是对的，尤其对不太熟悉的人来说。但这个问题靠mRNA microarray本身是无法回答的，表达改变的数据仅仅是一个很大翻为的帅选。筛选之后需要做相关验证（不可能对所有有表达差异的都一一验证，只能选一下差异大的可能有兴趣的进行验证）。即便验证完毕之后仍无法肯定这些变化就一定有或没有biological significance。要回答这些问题单靠Editor所建议的方法仍然使一些预测，有帮助但不能回答这种问题。

这样的问题真正回答只能回过头来对具体的基因进行功能方面的实验，如将内源性基因knockout或knockdown之后细胞的表型改变或相关pathway的变化等，当然也可以反过来让某一基因高表达，看相应变化。

按理说，一篇完整的论文应该有这样的内容，但估计你文中缺少这部分，所有会提出这个问题。

我想回答也只能说：这的确是一个重要而又实际的问题，也是我们接下来要解决的问题之一。