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Cydta

新虫 (初入文坛)

[求助] Chembiodraw里的Fragmentation Tool可以用于质谱图的预测分析吗 已有2人参与

我需要先用标准品做质谱,用的是LC-MS/MS QQQ质谱仪,需要对样品的碎片进行一些简单分析,例如碎片的断键方式之类。请问Chembiodraw里的Fragmentation Tool断裂预测可以用于辅助解析吗?有什么需要注意的地方呢?
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archbishop

禁虫 (职业作家)

优秀版主

应该是不行的。它模拟的是EI源的碎片断裂,LC-MS都是软电离源,我估计你用的八成是ESI,是模拟不出来的。
雲幕低垂映桂子,江月留白問柳心。
2楼2015-01-13 11:41:37
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鸭绿江畔

铁杆木虫 (著名写手)

牛B

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
那个软件模拟的原理,是基于EI源的原理,液质会有偏差。
我那么努力,就是为了在更高的层次遇见你!
3楼2015-01-13 11:43:26
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wy19871124

新虫 (职业作家)

质谱首席顾问

感谢参与,应助指数 +1
archbishop: 应助指数-1, 非应助回帖。 2015-01-13 13:56:52
请问Fragmentation Too项目在哪里?安装了ChemBioDraw但是未找到该项,是需要单独安装还是在ChemBioDraw里面呢?具体在哪里谢谢
4楼2015-01-13 11:58:33
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wy19871124

新虫 (职业作家)

质谱首席顾问

archbishop: 金币-1 2015-01-13 13:57:08
archbishop: 金币+1, 应助指数-1 2015-01-13 13:57:21
引用回帖:
4楼: Originally posted by wy19871124 at 2015-01-13 11:58:33
请问Fragmentation Too项目在哪里?安装了ChemBioDraw但是未找到该项,是需要单独安装还是在ChemBioDraw里面呢?具体在哪里谢谢

找到了,这个感觉不准确
5楼2015-01-13 12:01:11
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Cydta

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by archbishop at 2015-01-13 11:41:37
应该是不行的。它模拟的是EI源的碎片断裂,LC-MS都是软电离源,我估计你用的八成是ESI,是模拟不出来的。

嗯嗯,我用的是ESI源,刚刚用了一下,也发现不准这个问题。请问有没有什么更好的软件呢?我主要是想确定碎片离子中的碳位断裂顺序。我是小白,还请多多赐教呢
6楼2015-01-13 15:29:26
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Cydta

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 鸭绿江畔 at 2015-01-13 11:43:26
那个软件模拟的原理,是基于EI源的原理,液质会有偏差。

那液质分析用什么软件比较好呢?我主要是想确定碎片离子中的碳位顺序,比如说A碎片是母离子中的2、3、4碳位,B碎片是母离子中是2、3、4、5碳位。我是小白,还请多多赐教呢
7楼2015-01-13 15:32:01
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鸭绿江畔

铁杆木虫 (著名写手)

牛B

引用回帖:
7楼: Originally posted by Cydta at 2015-01-13 15:32:01
那液质分析用什么软件比较好呢?我主要是想确定碎片离子中的碳位顺序,比如说A碎片是母离子中的2、3、4碳位,B碎片是母离子中是2、3、4、5碳位。我是小白,还请多多赐教呢...

液质分析的话,各个公司的仪器,都会有自己的数据处理软件。都是随着仪器成套买的。
我那么努力,就是为了在更高的层次遇见你!
8楼2015-01-13 21:22:01
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