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吴吴姜姜

新虫 (初入文坛)

[求助] 罗非鱼做富集时的疑惑 已有1人参与

在分析罗非鱼的蛋白质组学的数据时,我需要做GO KEGG富集分析.

在做GO  enrichment时,在R 里面并没有发现罗非鱼这一物种的注释包,只发现Zebrafish(斑马鱼)的注释包(org.Dr.eg.db ),请问这个时候能用zebrafish的注释包吗?

在做KEGG enrichment 时,用genMAPP2.0中的pathvisio,发现这个数据库中也没有罗非鱼的通路注释,但是有zebrafish的通路注释!

请问有人知道怎么操作嘛?

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馒头爱生物

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

那你就用斑马鱼的做吧。做这种非常见物种分析的人,就是有这种困惑。这种请情况我们一般用大库或者相近物种库,暂时没发现别的好办法
2楼2015-01-25 22:56:11
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