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truemantwo

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】用Discover中的Analysis模块分析“Elastic properties (static)”?

先来说一下我的操作步骤:

首先导入一个MS自带的模型文件,地址是“C:\Program Files\Accelrys\Materials Studio 4.2\Structures\polymers\crystalline\nylon-6-6-alpha.msi”,而后把氢原子加上;

依次点击“Discover”-->“Analysis”-->“Mechanical”-->“Elastic properties (static)”;

在“Apply analysis to”下选择“Current structure in  nylon-6-6-alpha”;

单击“Analyze”开始计算。

这是程序生成的inp文件(删掉了一些没用的注释)
CODE:
#
  autoEcho off
#
# Begin Forcefield Section
  begin forcefield = compass
#
# Nonbond section:
  forcefield nonbond \
      +separate_coulomb \
    vdw \
    summation_method = atom_based \
      cutoff = 9.50 \
      spline_width = 1.00 \
      buffer_width = 0.50 \
    coulomb \
    summation_method = ewald \
      ewald_accuracy = 1.e-002 \
      update_width = 1.00 \
    dielectric_value = 1.0000
#
# vdW long range energy correction
  vdWTailCorrection 9.50
# End Forcefield Section
#
analysis \
         method = Elastic_Static

计算完成后,得到了一个out文件(我删掉了一些没用的东西):
CODE:
INPUT FILES
___________

File Type                Name
---------                ----

Forcefield                C:\PROGRA~1\Accelrys\MATERI~1.2\Discover\..\Data\Discover\res/compass.frc
Molecular data                nylon-6-6-alpha.mdf
Coordinate                 nylon-6-6-alpha.car

Space Group (P-1)

Periodic Boundary Conditions
____________________________

                Length (A)                Angle (degrees)
                ----------                ---------------

                a  4.90000                alpha  48.50000
                b  5.40000                beta   77.00000
                c 17.20000                gamma  63.50000


MOLECULAR TOPOLOGY
__________________

Number of molecules:                     1
Number of residues:                     1
Number of atoms:                    46 (asymmetric unit: 19)
Number of atom types:                     7
Number of bonds:                    38
Number of consolidated angles:            72
Number of consolidated torsions:   104
Number of bond_bond_1_3s:           104
Number of angle-angles:                   132
Number of out-of-planes:             4

FORCEFIELD OPTIONS
__________________

Filename                  : compass.frc
Definition name                  : cff91
Version                          : 2.7
Last modification date          : 7/28/2006
# of automatic parameters : 0

NONBOND ENERGY CUTOFFS
______________________

                Cutoff (A)        Spline Width (A)        Buffer Width (A)

vdW                  9.50                     1.00                     0.50
Coulomb                   --                       --                       --

NONBOND ENERGY EWALD PARAMETERS
_______________________________

                Accuracy (kcal/mol)        Update Width (A)

vdW                   --                               --
Coulomb                  0.01000000                     1.00

Summation method for vdW        : Atom based
Summation method for Coulomb        : Ewald
Dielectric                        : 1.00
NOTE: Pressure and energy tail corrections will be added to all subsequent energy evaluations


Total time used by DISCOVER: 6.59 secs

Completion date: Sat May 31 17:38:15 2008
Exiting Discover: status OK.

问题是,在这个out文件里并没有和“Elastic properties”有关的东西啊,比如弹性模量,剪切模量等等,这是怎么回事呢?


期盼各位高手解惑啊,万分感谢!
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truemantwo

木虫 (正式写手)

问题解决!
哇咔咔咔咔咔咔!
2楼2008-05-31 22:47:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xmc8362

银虫 (正式写手)

我也想知道?
3楼2008-06-02 00:10:11
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