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cvcy2046

金虫 (正式写手)

[求助] MTT结果分析,用OD值计算P值和用抑制率计算P值截然相反,为什么? 已有1人参与

各位请帮我解惑一下:
1.我做MTT的目的是想筛选出对肿瘤细胞生长没有影响的药物浓度,以便进行下一步的侵袭与迁移实验,依据标准是药物组(7个浓度组,1~64uM)与不加药干预的阴性对照组比较没有差异,即P>0.05,分别用OD值和抑制率(每组6个复孔,取均值,整个实验重复三次,最终每组得到三个均值)进行SPSS的单因素方差分析,方差齐后主要看药物组和阴性对照组的比较,前者有5个组是大于0.05,2个组是小于0.05的,而后者却是7个组全小于0.05,用OD值计算P值肯定符合我的实验目的,我想请问大家一般都是用OD值还是用抑制率作为原始数据去计算P值?两者差别怎么这么大?
2.外文文献基本都是用细胞存活率(我用细胞存活率去计算P值,也都是小于0.05),可以用OD值做柱状图或折线图描述药物对肿瘤细胞生长影响么?这样能发外文的文章么?我感觉不太直观!主要是纠结于用细胞存活率做图的话,那就得标上星号什么的,注释该组与阴性对照组有显著性差异,可是我要的就是没有显著性差异,用OD值做的话又不太直观。
请大家帮帮忙,多谢各位了!
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嘿小杨同志

金虫 (小有名气)

顶一下楼主,希望问题快点解决。
2楼2015-01-09 16:13:20
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rebecca_ying

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

我看的文章里面,貌似没有用直接用OD值的,都是用% control的。
MTT实验,本来就求的是个相对值,不是绝对的多少细胞存活。

但是数据处理方面,我也迷糊了。我也没搞清楚,到底是直接将1个浓度的平行样*重复数的所有OD放一起,求P
还是先分别算个%,再用三个%,来做单因素方差分析呢。。。
3楼2015-01-16 21:50:11
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rebecca_ying

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
cvcy2046: 金币+50, 有帮助 2015-01-17 07:35:03
还可以看论坛里的:MTT应该用OD值还是抑制率”做统计学检验”这个帖子,作者是forst
4楼2015-01-16 22:05:07
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cvcy2046

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by rebecca_ying at 2015-01-16 22:05:07
还可以看论坛里的:MTT应该用OD值还是抑制率”做统计学检验”这个帖子,作者是forst

这个帖子我看过,大多都是用重复三次得出的三个OD平均值,进行计算P值!若用每次实验的复孔OD进行计算P值只能得出该次实验的显著性,不能完全代表全部实验,所以还要重复三次,增加样本量。至于那个柱形图,的确我所知道的文献中它的纵坐标基本都是细胞存活率,我现在就是用浓度与其细胞存活率做柱状图,至于标星号(显著性差异)的原始数据来源,我用三次实验得出的三个OD平均值进行计算P值,然后在图标下进行注解。有外文文献是这样做的。谢谢你的回复

[ 发自小木虫客户端 ]
5楼2015-01-17 07:33:40
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rebecca_ying

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by cvcy2046 at 2015-01-17 07:33:40
这个帖子我看过,大多都是用重复三次得出的三个OD平均值,进行计算P值!若用每次实验的复孔OD进行计算P值只能得出该次实验的显著性,不能完全代表全部实验,所以还要重复三次,增加样本量。至于那个柱形图,的确我 ...

请问,那细胞存活率呢?
三次实验得出的三个OD平均值,再平均(在你的实验中,相当于18个OD值取1个平均),再和阴性对照的OD均值(18个OD值取平均),这样比,得%么?
还是先取%,再%的平均呢?

愣是把自己搞晕了。
6楼2015-01-17 15:55:40
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cvcy2046

金虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by rebecca_ying at 2015-01-17 15:55:40
请问,那细胞存活率呢?
三次实验得出的三个OD平均值,再平均(在你的实验中,相当于18个OD值取1个平均),再和阴性对照的OD均值(18个OD值取平均),这样比,得%么?
还是先取%,再%的平均呢?

愣是把自己搞 ...

不论是先算出三次实验中的每次的存活率,在取平均值得出存活率均值,还是算出三次实验中每次的OD平均值,在计算存活率均值,结果都一样的!我是用OD值去计算P值,所以在整理数据时用的是三次实验平均OD值计算存活率的。标准差也是三次实验平均OD值之间的标准差,如果你用存活率的话,那标准差可以通过三次实验得出的平均存活率计算得出。

[ 发自小木虫客户端 ]
7楼2015-01-19 07:34:58
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