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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 细胞科学 » MTT结果分析，用OD值计算P值和用抑制率计算P值截然相反，为什么？
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cvcy2046

金虫 (正式写手)

[求助] MTT结果分析，用OD值计算P值和用抑制率计算P值截然相反，为什么？ 已有1人参与

各位请帮我解惑一下：
1.我做MTT的目的是想筛选出对肿瘤细胞生长没有影响的药物浓度，以便进行下一步的侵袭与迁移实验，依据标准是药物组（7个浓度组，1~64uM）与不加药干预的阴性对照组比较没有差异，即P>0.05,分别用OD值和抑制率（每组6个复孔，取均值，整个实验重复三次，最终每组得到三个均值）进行SPSS的单因素方差分析，方差齐后主要看药物组和阴性对照组的比较，前者有5个组是大于0.05，2个组是小于0.05的，而后者却是7个组全小于0.05，用OD值计算P值肯定符合我的实验目的，我想请问大家一般都是用OD值还是用抑制率作为原始数据去计算P值？两者差别怎么这么大？
2.外文文献基本都是用细胞存活率（我用细胞存活率去计算P值，也都是小于0.05），可以用OD值做柱状图或折线图描述药物对肿瘤细胞生长影响么？这样能发外文的文章么？我感觉不太直观！主要是纠结于用细胞存活率做图的话，那就得标上星号什么的，注释该组与阴性对照组有显著性差异，可是我要的就是没有显著性差异，用OD值做的话又不太直观。
请大家帮帮忙，多谢各位了！
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1楼 2015-01-07 18:42:01
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嘿小杨同志

金虫 (小有名气)
顶一下楼主，希望问题快点解决。
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2楼2015-01-09 16:13:20
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rebecca_ying

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

我看的文章里面，貌似没有用直接用OD值的，都是用% control的。
MTT实验，本来就求的是个相对值，不是绝对的多少细胞存活。

但是数据处理方面，我也迷糊了。我也没搞清楚，到底是直接将1个浓度的平行样*重复数的所有OD放一起，求P
还是先分别算个%，再用三个%，来做单因素方差分析呢。。。
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3楼2015-01-16 21:50:11
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rebecca_ying

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
cvcy2046: 金币+50, ★有帮助 2015-01-17 07:35:03
还可以看论坛里的：MTT应该用OD值还是抑制率”做统计学检验”这个帖子，作者是forst
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4楼2015-01-16 22:05:07
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cvcy2046

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by rebecca_ying at 2015-01-16 22:05:07
还可以看论坛里的：MTT应该用OD值还是抑制率”做统计学检验”这个帖子，作者是forst

这个帖子我看过，大多都是用重复三次得出的三个OD平均值，进行计算P值！若用每次实验的复孔OD进行计算P值只能得出该次实验的显著性，不能完全代表全部实验，所以还要重复三次，增加样本量。至于那个柱形图，的确我所知道的文献中它的纵坐标基本都是细胞存活率，我现在就是用浓度与其细胞存活率做柱状图，至于标星号（显著性差异）的原始数据来源，我用三次实验得出的三个OD平均值进行计算P值，然后在图标下进行注解。有外文文献是这样做的。谢谢你的回复

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5楼2015-01-17 07:33:40
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rebecca_ying

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by cvcy2046 at 2015-01-17 07:33:40
这个帖子我看过，大多都是用重复三次得出的三个OD平均值，进行计算P值！若用每次实验的复孔OD进行计算P值只能得出该次实验的显著性，不能完全代表全部实验，所以还要重复三次，增加样本量。至于那个柱形图，的确我 ...

请问，那细胞存活率呢？
三次实验得出的三个OD平均值，再平均（在你的实验中，相当于18个OD值取1个平均），再和阴性对照的OD均值（18个OD值取平均），这样比，得%么？
还是先取%，再%的平均呢？

愣是把自己搞晕了。
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6楼2015-01-17 15:55:40
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cvcy2046

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by rebecca_ying at 2015-01-17 15:55:40
请问，那细胞存活率呢？
三次实验得出的三个OD平均值，再平均（在你的实验中，相当于18个OD值取1个平均），再和阴性对照的OD均值（18个OD值取平均），这样比，得%么？
还是先取%，再%的平均呢？

愣是把自己搞 ...

不论是先算出三次实验中的每次的存活率，在取平均值得出存活率均值，还是算出三次实验中每次的OD平均值，在计算存活率均值，结果都一样的！我是用OD值去计算P值，所以在整理数据时用的是三次实验平均OD值计算存活率的。标准差也是三次实验平均OD值之间的标准差，如果你用存活率的话，那标准差可以通过三次实验得出的平均存活率计算得出。

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7楼2015-01-19 07:34:58
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