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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 基因测序为99%,能继续吗?
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tianxie33

铁虫 (初入文坛)

[交流] 基因测序为99%,能继续吗?

我从肝文库调的一个基因今天测序结果回来了,准确率为99%,在最后100bp内有缺失,下一步要做Co-IP和酵母双杂交筛选相互作用蛋白,能用吗?实在不想在PCR了~表达检测都挺好的
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1楼 2008-05-30 19:50:36
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张力民

铜虫 (小有名气)
建议你重新弄吧，万一缺的那段是相互作用的区域呢
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2楼2008-05-30 19:54:57
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tianxie33

铁虫 (初入文坛)
问题是我重新弄了两次了~都这样,也不知道问题出在哪,有人说是测序公司大于800的片段会有误差~我都不知道怎么弄了
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3楼2008-05-30 20:57:43
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tianxie33

铁虫 (初入文坛)
在NCBI上查了一下,是翻译的同一个蛋白的
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4楼2008-05-30 20:59:18
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张力民

铜虫 (小有名气)
你可以让测序公司测通，看是不是测序错误。
缺失了一段碱基怎么会编码同样的蛋白呢，不明白什么意思。
还有另外一个可能，你扩增到的可能是这个基因的新的转录本，如果是这样，就恭喜你的新发现了。
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5楼2008-05-30 22:08:11
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tianxie33

铁虫 (初入文坛)
呵呵,谢谢哦,我有一个样品测通了,是最后100bp中的一个碱基突变了,但是表达很好呢不知道会不会影响,还有,要是重新开始的话,我是不是要重新设计引物?PCR的条件和模版都换了好多次了
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6楼2008-05-30 22:39:24
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张力民

铜虫 (小有名气)
我觉得可以继续，只要编码的蛋白质序列没变就行，而且你也验证表达没问题啊。可以继续，祝你成功！
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7楼2008-05-31 14:36:18
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tianxie33

铁虫 (初入文坛)
好的!!谢谢哦~
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8楼2008-05-31 20:13:28
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