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mla999金虫 (正式写手)
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[求助]
找到关联的SNP位点，怎样查找位点附近有没有其他的已定位的QTL 已有2人参与
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| 水稻的抗逆性状，我已经用全基因组关联分析找到显著关联的SNP位点，如何快速有效的查询这些位点附近是否有已经定位的QTL位点呢，难道要在文献中一篇一篇的查么？ |
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3楼2015-01-30 12:50:14
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
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理论上讲，确实需要一篇一篇查文献。 毕竟只是抗逆，你写过综述的话，有哪些相关的QTL，心里应该有数。 而且snp是对应到实际序列上的，和QTL这种定义在连锁群上的概念没有办法完全对接，除非是已经精细定位并验证过的。查有验证过的基因是有方法的，上这个网站 http://ensembl.gramene.org/Oryza ... 00;site=ensemblthis 找到你snp所在的染色体和具体位置，下面有基因注释，有的是预测的，有的是验证的，一个一个点着看吧 |
2楼2015-01-07 11:32:28
