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hankun88

禁虫 (小有名气)

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jghe

金虫 (著名写手)

你是想把某个分子吸附到这三个分子上去吗? 可以这样算,我觉得要选择一个位置在优化,最后用总能量减去部分能量得到结合能,那里的结合能最大哪里就最合适
2楼2008-05-30 20:28:31
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yuzhan

木虫 (正式写手)

Keep moving forward

我也很想作一些双分子结合位点方面的计算,但是刚刚起步。

真心求教。请问楼主:“把优化好的分子以不同的相对位置放置”,这个相对位置如何判定呢?是随便找几个位置,还是高斯有这样的功能可以按照一个最小值,逐步变化?
3楼2008-05-30 21:45:07
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hankun88

禁虫 (小有名气)

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4楼2008-05-31 19:59:57
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hankun88

禁虫 (小有名气)

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5楼2008-05-31 20:16:13
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