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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 帮忙做下三级结构
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xyf1688

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[交流] 帮忙做下三级结构

请人帮忙啦！
可不可以帮忙把下面的这个蛋白质序列做下三级结构！只要有个图就行!
比较急！两天之内就要。


>Mus musculus pnpla1
MDEQVFKGDPDTPHSISFSGSGFLSYYQAGAVDALRDLAPRMLD
TAHRFAGTSAGAVIAALVVCGIEMEKYLRVLNMGLAEVKKFFLGPLSPSCKMVQMMRQ
FLYDVLPEDSYKFATGKLHVSLTRVTDGENVVVSEYRSKEELIEALYCSCFVPVYCGF
IPPTYRGERYIDGGFTSMQPCSFWTDSITISTFSSQQDICPRDCPTIFHDFRMFNFSF
QFSLENITRMTHALFPPDLVILQEYYYRGYNDAVSYLRRLNAAYLDSPSKRVIFPRVE
VYCQIEVALGHEPPPPSLQNLPALRRSPADSSQTHAQGSPKKDRKDSHSSAAPSVQTP
ESGCKESVESPVSLRVSISKQPSVSPLSPAQPVPVMRPTGPRDSCPINVQTPNPERGV
KGALDSATERGMKDALASATDEQSTTTLPPVLLPAADSRGSKTGSSVPIGSPESPRLL
LRSSQGATASRATLGLPPLSPSTPPAGPPVEDLGPERPTATGSPALSQLTGSAAPGTG
KKAPHKPLLVEGPGEDSNTAKTMFKRKQKTNATRECFHRNAQSKKPASKLKSAPCPLN
FPVLPKRVWVTYKPHPSRIQDYSYPEGVSGQNS



请楼主代转下金币
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1楼 2008-05-30 17:20:45
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akvact

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lixiaoyi1981(金币+0,VIP+0):助人为乐，自然要奖励的。欢迎常来转转
lixiaoyi1981(金币+2,VIP+0):谢谢
xyf1688(金币+6,VIP+0):多谢啦，呵呵
SWISS MODEL做的预测，看看是不是你要的。
赞一下(21人) 回复此楼
讲实话和说谎一样简单，所以说实话——实验下代价如何！haha
2楼2008-05-30 18:13:56
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xyf1688

捐助贵宾 (小有名气)
多谢，比我做的好多了
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3楼2008-05-30 23:10:31
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akvact

木虫 (著名写手)
呵呵，不客气
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讲实话和说谎一样简单，所以说实话——实验下代价如何！haha
4楼2008-05-30 23:17:27
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xyf1688

捐助贵宾 (小有名气)
可不可以再帮帮忙做下这两个序列的，替别人做的，麻烦啦




>Homo sapiens
MVQMMRQFLYRVLPEDSYKVTTGKLHVSLTRLTDGENVVVSEFT
SKEELIEALYCSCFVPVYCGLIPPTYRGVRYIDGGFTGMQPCAFWTDAITISTFSGQQ
DICPRDCPAIFHDFRMFNCSFQFSLENIARMTHALFPPDLVILHDYYYRGYEDAVLYL
RRLNAVYLNSSSKRVIFPRVEVYCQIELALGNECPERSQPSLRARQASLEGATQPHKE
WVPKGDGRGSHGPPVSQPVQTLEFTCESPVSAPVSPLEQPPAQPLASSTPLSLSGMPP
VSFPAVHKPPSSTPGSSLPTPPPGLSPLSPQQQVQPSGSPARSLHSQAPTSHRPSLGP
STVGAPQTLPRSSLSAFPAQPPVEELGQEQPQAVALLVSSKPKSAVPLVHVKETVSKP
YVTESPAEDSNWVNKVFKKNKQKTSGTRKGFPRHSGSKKPSSKVQ

>Pan troglodytes
MVQMMRQFLYRVLPEDSYKVTTGKLHVSLTRLTDGENVVVSEFT
SKEELIEALYCSCFVPVYCGLIPPTYRGVRYIDGGFTGMQPCAFWTDAITISTFSGQQ
DICPRDCPAIFHDFRMFNCSFQFSLENIARMTHALFPPDLVILHDYYYRGYEDAVLYL
RRLNAVYLNSSSKRVIFPRVEVYCQIELALGNECPERSQPNLRARQASLEGATQPHTE
WVPKGDGRGSHGPPVSQPVQTLEFTCESPVSAPVSPLEQPPAQPLASSTPLSLSGMPP
VSFPAVHKPPSSTPGSSLPTPPPGLSPLSPQQQVQPSGSPARSPHSQAPTSPRPSLGP
STVGAPQTPPRSSLSAFPAQPPVEELGQEQPQAVALLVSSKPKSAVPLVHVKETVSKP
YVMESPAEDSNWVNKVFKKNKQKTSGTRKGFPRHPGSKKPSSKVQ
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5楼2008-05-31 10:08:21
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akvact

木虫 (著名写手)
非常抱歉，
我做结构预测并不是很专业，我只做过“同源性建模”法预测的，由于下面的两个序列数据库中无相似模式“No Templates found.”，所以并不适用同源建模。
可能要用threading等方法预测。

   希望有其他虫友能帮你完成。

另外，等有时间希望可以向您请教关于蛋白结构预测的方法，呵呵

[ Last edited by akvact on 2008-5-31 at 13:25 ]
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讲实话和说谎一样简单，所以说实话——实验下代价如何！haha
6楼2008-05-31 11:56:36
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skkyy88888

铜虫 (著名写手)
呵呵,其实我也不太懂.

什么时候一起讨论吧!

多谢你啦
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7楼2008-06-02 16:27:35
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xyf1688

捐助贵宾 (小有名气)
呵呵，不小心用了别人的号回哈
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8楼2008-06-02 16:31:32
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akvact

木虫 (著名写手)
呵呵，别客气，有空探讨探讨
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讲实话和说谎一样简单，所以说实话——实验下代价如何！haha
9楼2008-06-02 17:42:14
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