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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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oyangyijia

金虫 (正式写手)

[交流] 基因翻译中gap信息用不用去掉?

大家好,如果要翻译一段碱基序列,但该序列中有gap的信息,那么在翻译的时候用不用把它去掉呢?谢谢大家!
例如要翻译序列:
3001 ctaagaattc gcttcatagc cactaagtga cactccttaa ggatcggatt gaaaatctag
3061 cacacatgca tacgctaagc ataatatccg gtctactagc acataaataa agtaaagacc
3121 ctatcattga ccggtatgct ttttgatcaa cggacttacc tcctttgttg aggtcggtgt
3181 gtccgtcggt tcccatcgga gtctttgcgg gcttggcgtc cttcatccca aaccgcttta
3241 gcagatcttg cgtatacttc gtttgggaga tgaaggtgcc gtccttgagt tgcttcactt
3301 ggaacccaag gaagtagttc aactcgccca tcatcgacat ctcgaatttc tgcgtcatca
3361 ccctgctaaa ctcttcacaa gacttttggt tagtagaacc aaatattatg tcatcgacat
3421 aaatttggca cacaaacaaa tcaccatcac atgtctttgt aaaaagagtt ggatcggctt
  3481 tcccaacctt gaaagcatta gcaattaaaa agtctctaag gcattcatac catgctcttg
  3541 gggcttgctt aagtccatag agcgccttag agagcttaca cacgtggtcg gggtaccgtt
   3601 catcctcgaa gccagggggt tgctctacgt acacttcctc cttgattggc tctgttgagg
   3661 aaagcgctct tcacatccat tttggtacaa acctgaaaga atggtgagcg gcatatgcta
   3721 gcaagattcg aaatgaattc tagtctagct accggagcaa aagtctccc           
          [gap 100 bp]    Expand Ns
3870                                g tctgatgaat cagcttgatt cgtaacttga
3901 ccgttggtgg aggttgtctg tttgatggcg caccggacag tccggtgcac accggacatg
   3961 accggtgccc cagccacgtc accaatgccg ttggattctg accgttggag cttctgactt
  4021 ctgggcccgc ctggatgtcc ggtgcacacc ggacatgtcc tgttcattgt ccggtgcgcc
4081 agtatgggca cgcctgacgt ctgcgcgcgc agcgcgcgca ttaaatgcgtcgcaggtagc
4141 cgttggcgcc gaaatagccg ttgctccgct gttacaccgg acagtccggt gaattatagc
4201 ggagcggctg aagtgaattc ccgaggctgg cgagttccgg aggccgccct tccttggagc
4261 accggacatg tccggtgtac accggacagt ccggtgaatt atagcggagt ggcctccgta
4321 aattcccgaa ggtgacgagt ttgaagtttg agttctctgg tgcaccggac atgtccggtg
4381 gcacaccgga cagtccggtg cgccagacca gaggagcctt cggttgaccc tttgctcttt
4441 tggttgaacc caatacttgg tctttttatt ggctaagtgt gaaccttttg cacctgtata
4501 acttatacac tagagcaaac tagttagtcc aatatttgtg ttggacaatt caaccaccaa
4561 aattaattag ggtctaggtg taagcctaat tccctttcaa
下划线的部分用不用去掉呢?
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shenqicc

金虫 (小有名气)

★ ★
oyangyijia(金币+2,VIP+0):xiexie
不用吧,这种gap我们也经常碰到,尤其在网上比对不同构象的同种酶的基因序列时老碰到,其实在翻译时是不用作什么改变的,跟没有gap的情况其实可以看作等同,只是它在与网上库里面的序列进行模拟比对时会显示出有gap而已,纯属个人意见呵呵~~
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2楼2008-05-29 17:29:28
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oyangyijia

金虫 (正式写手)

Expand Ns
用这个链接可以把gap变成n
3楼2008-05-29 19:37:11
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