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[交流] Pharmaco-metabonomics(药物代谢组学)

随着代谢组学的发展,Clayton等于2006年提出了”药物代谢组学” (pharmaco metabonomics)的概念:以代谢组学为平台,通过给药前生物样本的代谢轮廓分析预测给药后的药物反应表型。药物代谢组学同样以整体和动态的观点来认识、解释、进而预测个体对药物治疗的效应,它们的发展将有力推动个性化治疗,尤其是两者与中医学的辨证施治思想相结合,必将促进现代药物治疗水平的提升以及未来医疗模式向系统化转变,极大地促进中医药学科的现代化发展。
  技术路线及方法:
  该服务方案是从样本预处理到结果分析一整套全面解决方案,客户只需要提供足够的样本就可以及时获得科学结果。我们也可以针对客户的实际情况量身定做方案,客户也可以选取其中几项服务。我们将竭诚为客户解决问题。
     首先您跟我们沟通您的实验目的与实验设计,或者让我们专业的技术人员根据您的实验目的帮助您设计实验。然后提供样品(可以是组织,细胞或血液),我们为您完成所有的实验操作,并提供完整的实验报告和数据分析报告。 特别的,在项目结束后6个月的时间内我们提供一次免费报告修回和7×24h的问题答疑服务。根据您的需要,我们为您推荐最合适的实验方案。

药物代谢组学平台:
型号UPLC-Q-TOF-MS
厂商ACQUITY UPLC/Micromass Q-TOF Premier MS Waters
货号BT4000111
型号 GC-Q-MS
厂商7890A GC/5975C MS  Agilent
货号BT4000121
型号 GC×GC-TOF MS
厂商 Pegasus 4D  LECO (USA)
货号 BT4000122
型号GC-TOF-MS
厂商 Pegasus HT LECO(USA)
货号 BT4000123
型号 NMR
厂商Varian Inova 600M   Agilent
货号BT4000131
型号 Bruker Avance600M
厂商Bruker
货号 BT4000132
     我们检测过各种类型的中药,毒素,重金属,营养物质处理的各种动物模型,包括大鼠,小鼠,猴子,牛,猪,鸡,线虫,鲟鱼,斑马鱼等,对药物代谢组学实验设计具有丰富的经验。
血清:

1、样品量要求:

NMR:500µl/例 (不得低于200µl/例);

GC-MS or LC-MS: 200ul/例;

一定避免反复冻融。

2、收集步骤:血液收集在离心管中静置30分钟进行凝固。然后3000rpm离心5分钟,取上清装载干净的离心管中,再离心5分钟,8000rpm,取上清分装到冻存管中,每管0.2 or 0.5ml,立即-80度冻存,直到干冰寄送。

3、注意事项:

(1)取血时如用酒精消毒,请擦干擦拭部位,待酒精完全挥发后再取样。

(2)取血时如用麻醉剂,建议用异氟醚 ,防止在NMR血清谱图中出现干扰峰。

(3)如要采用血浆,请务必使用肝素钠抗凝管。

尿液:

1、样品量要求:1ml/例,原则上可以多取一点。

2、收集步骤:尿液直接分装到离心管中,每管1ml,添加一滴(约10µl)质量体积为1/100(w/v)的叠氮化钠,-80度冻存寄送。

其他种类的样品在收集之前请联系公司销售工程师。

数据分析内容

基本数据分析

Part01:数据预处理

Part02:PCA分析

Part03:PLS-DA分析

Part04:OPLS-DA分析

Part05:差异化合物筛选

Part06:差异化合物鉴定

高级数据分析

Part07:多组分关联分析(同一标本同时取多组分)

Part08:代谢通路分析


Part09:代谢网络分析

Part10:多组学数据关联分析(具备多组学数据)
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