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fortran程序如何在linux系统的服务器上进行编译呢？makefile文件怎么写呢？ 已有1人参与
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test文件夹中有如下文件： H.f p.f s.f Makefile Makefile文件如下： FINCLUDES=p.f FFLAGS = -O3 -xHOST -ipo -static -no-prec-div FC=ifort SOURCES= H.f s.f OBJECTS = $(SOURCES:.f=.o) TARGET=H.exe $(TARGET): $(OBJECTS) $(FC) $(FFLAGS) -o $(TARGET) $(OBJECTS) clean:; rm -f $(OBJECTS) $(TARGET) 但是在服务器上qsub Makefile后，出现如下错误： line 2: FFLAGS: command not found line 4: H.f: command not found line 5: SOURCES:.f=.o: command not found line 5: OBJECTS: command not found line 6: TARGET: command not found line 7: OBJECTS: command not found line 8: FC: command not found line 8: FFLAGS: command not found line 8: TARGET: command not found line 8: OBJECTS: command not found line 8: -o: command not found line 9: clean:: command not found line 9: OBJECTS: command not found line 9: TARGET: command not found 为何会出现以上问题呢？是哪里错了？还是我提交的缺少mhd？，或者我应该提交qsub mhd.pbs文件呢？求解答！谢谢啦！ |
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qsub提交的本质是一个shell脚本，而Makefile是专门给make命令准备的，队列系统如果按照shell命令来辨别的话肯定不认，所以出现一堆错误。 你的pbs脚本可以这样准备： #!/bin/bash #PBS -S /bin/bash #PBS -N makefile_test #PBS -l nodes=1:ppn=4 NPROCS=`wc -l $PBS_NODEFILE` make -j${NPROCS} 将上面的内容保存为make.pbs.sh，然后 qsub make.pbs.sh就可以了。make会自动寻找当前目录下的Makefile文件，并执行。如果需要指定某个Makefile，可以将最后一行变为： make -j${NPROCS} -f make_file，其中make_file就是你需要指定的Makefile文件名。上面的PBS脚本内容你可以根据自己的实际需要进行修改。如果使用SGE的话，脚本示例如下： #!/bin/bash #$ -S /bin/bash #$ -N makefile_test #$ -pe orte 4 NPROCS=`wc -l $SGE_NODEFILE` make -j${NPROCS} 其它的脚本系统就不清楚了。你可能需要先了解自己使用的队列系统和脚本编写的基础知识。 |
2楼2014-12-25 15:07:55
3楼2014-12-25 18:36:22
4楼2014-12-25 20:35:25
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我把mpirun去掉了，改成以下形式 文件有： H.f p.f s.f Makefile make.pbs.sh Makefile里面没有动，还是最上面我贴出的那些。 make.pbs.sh如下： #!/bin/bash #PBS -N test #PBS -o test.stdout #PBS -e test.error #PBS -l nodes=1:ppn=1 #PBS -q batch PBS_O_WORKDIR=/home/code/ cd $PBS_O_WORKDIR NPROCS=`wc -l $PBS_NODEFILE` make -j${NPROCS} 现在出现的问题是： make: Nothing to be done for `/opt/gridview//pbs//dispatcher/aux//7131.node25'. |
5楼2014-12-26 16:11:44