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sxtx0607

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 怎样判断RNA是否发生了降解

用什么标准判断RNA是否发生降解,那个标准是否就完全的可靠啊,有什么因素可以导致RNA降解
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111111
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hotdunk

金虫 (正式写手)

电泳检测看看28S和18S的主带有没有,弥散是否严重,主带不清晰说明已降解。

样品空气中暴露时间长,试剂污染,操作不符合规范都容易产生降解。细心做几次就总结出来了,RNA没有那么难提的~ Good Luck~
爱情来得快去得也快,只有猪肉卷是永恒的!
2楼2008-05-27 09:39:17
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seahow

木虫 (著名写手)

最简单的方法是跑胶, 看28s和18s的比例大约为2:1左右, 这样的RNA可用. 5s很少的.
如果降解了,则比例小了 5s多了, 很简单,降解了 小分子多了. 这个标准最可靠.

  RNA很容易降解的,主要是rnase活力太强了.

呵呵
3楼2008-05-27 09:43:08
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raindrop8316

金虫 (正式写手)

本人长期提RNA,个人觉得28s,18s,5s的比例并不是很重要,因为不同物种还是存在一定差异的。
关键还是看有无主带,是否弥散,弥散的肯定是降解了的。
如果只是做简单的RT-PCR,只要28s和18s主带非常清晰,不管是否是2:1的比例都是可以做出来的。
一般只要试剂不污染,操作仔细小心,勤换手套,RNA并没有传说中的那么容易降解。
以上纯属个人看法。
书到用时方恨少 钱到月底不够花
4楼2008-05-27 11:00:55
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sxtx0607

铁杆木虫 (正式写手)

非常感谢几位给的建议
111111
5楼2008-05-28 10:42:47
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