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luanyingwei

木虫 (初入文坛)

[求助] atomeye中的voronoirize怎么用

李巨的atomeye可视化软件中voronoirize怎么用,之前有人说用voronoirize input.cfg fcc 2 2 2 output.cfg这个命令,就是说voronoirize是一个可执行文件?下载软件时只下到A.i686这个文件啊。现在atomeye网站也打不开了。哪位了解指导一下~~
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18273603720

新虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by luanyingwei at 2015-07-05 20:20:37
哦,我又试了一下,voronoirize有random的选项。可以随机设置seed的位置。但现在的新问题是,总有很多晶界位置的原子被删掉了,这个怎么调试啊。voronoirize input.cfg random n1 n2 n3 output.cfg中,n1,n2,n3可以 ...

你这是在得到的模型中从中间截的一个平面吗?还是截的两个平面中间所夹的部分(两平面间的距离比较小)?楼主
29楼2017-07-23 08:22:01
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差点儿是帅哥

金虫 (著名写手)

好好学习,天天向上
2楼2015-05-14 10:27:38
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差点儿是帅哥

金虫 (著名写手)

输入cfg文件下载地址:
http://li.mit.edu/Archive/Graphics/A/voronoirize/FCC10x10x10.cfg
这个是输出CFG文件地址:
li.mit.edu/Archive/Graphics/A/voronoirize/FCC10x10x10-voronoirized.cfg
http://li.mit.edu/Archive/Graphi ... 10-voronoirized.cfg


需要先下载并安装: voronoirized.i686
然后在终端中输入:voronoirize FCC10x10x10.cfg bcc 2 2 2 FCC10x10x10-voronoirized.cfg
得到输出文件:FCC10x10x10-voronoirized.cfg
输出文件可视化方法:./A FCC10x10x10-voronoirized.cfg
之后 在图上按k键,如下解释:
would divvy up FCC10x10x10.cfg into 16 truncated octahedron grains pieced together, FCC10x10x10-voronoirized.cfg, which can then be visualized by
A FCC10x10x10-voronoirized.cfg
Pressing 'k' (coordination number coloring) would allow one to clearly see the grain boundaries.
好好学习,天天向上
3楼2015-05-14 10:33:10
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luanyingwei

木虫 (初入文坛)

你好,谢谢关于我那个voronoirize使用的提问啊,在你的指导下,我可以顺利使用了,现在atomeye的网站也能打开了。
还有一个问题想请教一下啊。我生成的多晶构型晶体是按一定规律排列的,在x,y,z方向都是可按晶粒平移周期性的。atomeye网站上FCC10x10x10-voronoirized.cfg和FCC30x30x30-voronoirized.cfg的构型也是这样的。但我看到很多文献中的多晶构型晶粒是随机排布的。想请教一下有没有随机排布晶粒的方法啊~~
不知道怎么能发图片给你,想把随机晶粒的图片发给你。
atomeye中的voronoirize怎么用
A_molecular_dynamics_study_of_void_initiation_and_growth_in_monocrystalline_and_nanocrystalline_copper.jpg

4楼2015-07-05 19:18:41
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