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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » ［求助］计算结果的势能值为正？
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gamma337

银虫 (小有名气)

[交流] ［求助］计算结果的势能值为正？

我在作分子动力学计算时，在模拟之前我在NVE系综下对时间步长作了估计，在步长值为16个fs时体系的能量仍是稳定的。

在实际模拟的时候，我用NPT系综，采用的是2.5个fs，发现模拟出的结果总的能量和体系的势能都是正的，温度也相当的高，我想把体系的温度固定在800K，却发现温度远远高于800K，达到了20万K，这个是什么原因呢？

[ Last edited by gamma337 on 2008-5-27 at 09:30 ]
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1楼 2008-05-26 16:37:42
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lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主
★ ★ ★ ★
csfn(金币+3,VIP+0):3q
gamma337(金币+1,VIP+0):有可能
你固定能量了 初始结构如果不对的话（有可能原子间距不合理） 会导致温度升高
动能平均到原子上引起能量为正
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2楼2008-05-30 11:17:16
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znet0201

金虫 (正式写手)
★
gamma337(金币+1,VIP+0):呵呵，这个就不用说了吧
用VMD看看你的体系吧，肯定是变成糨糊了，overlapping!!
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3楼2008-06-04 00:20:58
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honghuzlj

木虫 (著名写手)
★
gamma337(金币+1,VIP+0):仔细看，能看清楚的
ls的说的不清不楚的
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4楼2008-06-06 15:54:53
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