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xujingyuanxu

铜虫 (正式写手)

[求助] DNA条形码序列拼接比对的问题,求指教! 已有1人参与

最近做DNA条形码有ITS这一段,同一种植物不同的个体所提取的模板用相同引物扩增后双向测序,得到的结果其碱基数不一样;对所得的序列进行比对拼接,去除低质量区,所得到的结果碱基数目和NCBI上的有出入,该怎么确定起始和结束的部位呢?求大神指点!
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我努力,我坚持,我成功!
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lzbull

木虫 (小有名气)

同有疑问,请问楼主解决了吗?
2楼2014-12-23 10:38:42
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xujingyuanxu

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lzbull at 2014-12-23 10:38:42
同有疑问,请问楼主解决了吗?

没有!做起来很郁闷!
我努力,我坚持,我成功!
3楼2014-12-23 12:18:30
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guxinhan123

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
xujingyuanxu(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-12-23 19:12:26
双向拼接后去除引物序列
4楼2014-12-23 14:25:41
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