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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 测序
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646800558

木虫 (小有名气)

[求助] 测序 已有3人参与

链霉菌测序结果1414bp,在NCBI中有百分之百相似的，在韩国网站EzBioCloud里面却只有百分之四十多，为什么啊？
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1楼 2014-12-22 17:51:12
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wenqingshe

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

你有可能比对的是反向序列，
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2楼2015-01-21 19:54:47
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dgm1208

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

EzTaxon的那个对序列的要求比较高，事儿多，首先把序列反向互补一下再比对就正常了
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科研路艰辛···
3楼2015-01-23 16:20:36
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大土豆片

新虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by dgm1208 at 2015-01-23 16:20:36
EzTaxon的那个对序列的要求比较高，事儿多，首先把序列反向互补一下再比对就正常了

一直想找个人帮我看看我的树到底哪里不对，有人说序列反了，可是我不知道具体该怎么弄！可以请教一下这位高手么？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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小短腿啊，小短腿啊！快点跑过来。。
4楼2015-01-24 00:33:03
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416114799

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

把正向引物和序列一起导入dnaman比对，就知道正反了，然后用primer5进行反互补

[ 发自小木虫客户端 ]
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做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
5楼2015-01-24 00:50:51
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dgm1208

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 大土豆片 at 2015-01-24 00:33:03
一直想找个人帮我看看我的树到底哪里不对，有人说序列反了，可是我不知道具体该怎么弄！可以请教一下这位高手么？
...

我一直用的DNAMAN。新建一个，把序列复制进去，然后导入序列， 再点序列按钮，有个显示序列，然后有反向互补这一项，不过结果出来是已经格式化好的啦，你需要把其中的数字和空格去掉，再提交
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科研路艰辛···
6楼2015-01-24 08:39:55
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