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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

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[交流] [求助]大家给点立题的意见

我做分子对接，想结合中药立个硕士论文的题目，可是怎么也想不好，各位天才的同仁给些意见吧！

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1楼 2008-05-26 08:55:28

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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

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管辖: 计算模拟

★ ★
suntao1982(金币+2,VIP+0):谢谢交流!

中药的主要化学成分：
需要出色的分离、鉴定技术

靶标的确认：
难

所以，作为硕士
最多也就是从文献中选一种有活性的分子
并且该分子作用的受体已知，最好有PDB晶体
然后对其结构进行优化，预测其活性
（有时间合成新化合物、完成活性筛选？）

这里，优化有两种含义
1）能量优化：改变构象
2）结构优化，改变结构，使得其衍生物有可能具备更好的活性。

分子对接不过是相对地比较一系列类似化合物的与同一受体结合的情况。
此外，QSAR也可以用来相对地比较一系列类似化合物的情况
其中，还分为2D-QSAR, 3D-QSAR以及更多高维QSAR。

3D-QSAR中，CoMFA和CoMSIA是比较常用的。

这些只是计算、模拟方面的工作

实验方面，还有很多工作要做。