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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 目的基因在scaffold上的location为6612-34213(-)，如何寻找UTR区域？
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胡乱走走2011

银虫 (著名写手)

[求助] 目的基因在scaffold上的location为6612-34213(-)，如何寻找UTR区域？ 已有1人参与

如题，想请教下，3‘UTR是否应该是《6612区域，5’UTR应该是》34213区域？
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Things change, people grow.
1楼 2014-12-15 14:09:50
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 胡乱走走2011 at 2014-12-15 16:44:31
已经知道基因的CDS序列，只是scaffold6612-34213(-)中 (-) 这个表示反向是反向的吗？...

这种表示不太清楚，你看看你的CDS区域与这段序列方向是否一致，不一致估计这种符号就是反向。
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hehe
4楼2014-12-16 09:09:32
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-12-15 18:07:38
你先分析一下你的基因的编码序列，找到起始密码子跟终止密码子就容易分析了。
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hehe
2楼2014-12-15 15:03:20
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胡乱走走2011

银虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lvbobo823 at 2014-12-15 15:03:20
你先分析一下你的基因的编码序列，找到起始密码子跟终止密码子就容易分析了。

已经知道基因的CDS序列，只是scaffold6612-34213(-)中 (-) 这个表示反向是反向的吗？
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Things change, people grow.
3楼2014-12-15 16:44:31
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胡乱走走2011

银虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by lvbobo823 at 2014-12-16 09:09:32
这种表示不太清楚，你看看你的CDS区域与这段序列方向是否一致，不一致估计这种符号就是反向。...

好的，谢谢啦
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Things change, people grow.
5楼2014-12-16 14:32:21
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