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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » ECoRI 酶切位点少了个A会切开吗？
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huoxingshizhe

铁虫 (小有名气)

[交流] ECoRI 酶切位点少了个A会切开吗？

测序回来发现，ECoRI GAATTC变成了GATTC。但是酶切也切开了，请问ECoRI可以识别GATTC吗？还是测序有问题？但是我看峰图还好啊！
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1楼 2008-05-23 12:10:16
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guoqin_shiyin

银虫 (正式写手)
我看是测序的问题
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2楼2008-05-23 13:13:00
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碧荷叶

铜虫 (初入文坛)
ECoRI 好像有星活性
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3楼2008-05-23 13:53:17
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香菱儿

铁杆木虫 (著名写手)
可能主要是测序 basecalling 的问题
也不排除是序列本身的问题及酶的star activity 的问题
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漫洒英雄泪，相离处士家。谢慈悲剃度在莲台下。没缘法转眼分离乍。赤条条来去无牵挂。那里讨烟蓑雨笠卷单行？一任俺芒鞋破钵随缘化！
4楼2008-05-23 16:18:29
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hotdunk

金虫 (正式写手)
以测序峰图为准，测序单位给出的结果仅供参考，不一定完全正确的。我也碰到过类似的情况~
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爱情来得快去得也快，只有猪肉卷是永恒的！
5楼2008-05-23 20:21:43
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phyllislhy

木虫 (正式写手)
你做一个预实验,看能不能酶切开!我以前测序也发生过这样的情况,本来以为是测序问题,其实是本身引物合成时就没把酶切位点弄完全!
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6楼2008-05-26 10:54:39
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huoxingshizhe

铁虫 (小有名气)
引物合成报告没有问题，峰图也还好。我正在做验证，谢谢各位啦！
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7楼2008-05-27 10:27:12
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