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huoxingshizhe

铁虫 (小有名气)

[交流] ECoRI 酶切位点少了个A会切开吗?

测序回来发现,ECoRI GAATTC变成了GATTC。但是酶切也切开了,请问ECoRI可以识别GATTC吗?还是测序有问题?但是我看峰图还好啊!
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guoqin_shiyin

银虫 (正式写手)

我看是测序的问题
2楼2008-05-23 13:13:00
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碧荷叶

铜虫 (初入文坛)

ECoRI 好像有星活性
3楼2008-05-23 13:53:17
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香菱儿

铁杆木虫 (著名写手)

可能主要是测序 basecalling 的问题
也不排除是序列本身的问题及酶的star activity 的问题
漫洒英雄泪,相离处士家。谢慈悲剃度在莲台下。没缘法转眼分离乍。赤条条来去无牵挂。那里讨烟蓑雨笠卷单行?一任俺芒鞋破钵随缘化!
4楼2008-05-23 16:18:29
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hotdunk

金虫 (正式写手)

以测序峰图为准,测序单位给出的结果仅供参考,不一定完全正确的。我也碰到过类似的情况~
爱情来得快去得也快,只有猪肉卷是永恒的!
5楼2008-05-23 20:21:43
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phyllislhy

木虫 (正式写手)

你做一个预实验,看能不能酶切开!我以前测序也发生过这样的情况,本来以为是测序问题,其实是本身引物合成时就没把酶切位点弄完全!
6楼2008-05-26 10:54:39
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huoxingshizhe

铁虫 (小有名气)

引物合成报告没有问题,峰图也还好。我正在做验证,谢谢各位啦!
7楼2008-05-27 10:27:12
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