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Lotus_ping新虫 (小有名气)
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map QTL5结果求分析
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我用map QTL5给一个F1群体进行QTL定位，是分别以两亲本的图谱作图，一亲本图谱是高密度的（0.7CM），另一亲本图谱是低密度（6.6CM）,现在结果如下： 1.用区间作图，高密度的LOD值都超低，超过2的都少；低密度的LOD值相对高些，但是贡献率都好高 2.用1000次排布检测，高密度图谱确定的阈值都不高，2左右，但是低密度的阈值都较高，一般4到5，有的甚至到10了，正常吗？ 3.以低密度图谱IM检测到的QTL最高点为辅助因子，进行MQM作图，辅助因子处的LOD都降下来了……什么情况？  低密度MQM作图.jpg  低密度图谱IM作图.jpg  高密度图谱IM作图.jpg |
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