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Lotus_ping

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[交流] map QTL5结果求分析

我用map QTL5给一个F1群体进行QTL定位，是分别以两亲本的图谱作图，一亲本图谱是高密度的（0.7CM），另一亲本图谱是低密度（6.6CM）,现在结果如下：
1.用区间作图，高密度的LOD值都超低，超过2的都少；低密度的LOD值相对高些，但是贡献率都好高
2.用1000次排布检测，高密度图谱确定的阈值都不高，2左右，但是低密度的阈值都较高，一般4到5，有的甚至到10了，正常吗？
3.以低密度图谱IM检测到的QTL最高点为辅助因子，进行MQM作图，辅助因子处的LOD都降下来了……什么情况？

map QTL5结果求分析
低密度MQM作图.jpg


map QTL5结果求分析-1
低密度图谱IM作图.jpg


map QTL5结果求分析-2
高密度图谱IM作图.jpg
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1楼 2014-12-09 10:32:18
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