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zawz99

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

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玉砌的强: 金币+15, 翻译EPI+1, ★★★很有帮助 2014-12-09 21:54:10
种子萌发和幼苗建立测定种子表面消毒后,分层在黑暗中进行在4℃下3天。接着,100种子每种基因型的播种在MS平板缺乏或补充有0.5mM的ABA,150 mM氯化钠,或400毫甘露醇。在iDDA1行分析,使用与1 mMABAwas B-雌二醇加入到培养基中,在10mM的最终浓度如所述。得分种子发芽,胚根出现在播种后72和96小时进行分析。苗成立了进球后5天作为种子的百分比绿色发展子叶扩大和第一对真叶。根生长测定幼苗生长在垂直取向的MS平板进行4至5天。随后,20株植物被转移至新的MS平板缺乏或补充用10mM的ABA。将平板上扫描平板扫描仪10 d后产生图像文件适用于根的定量分析使用ImageJ1.37版本软件的增长系统发育分析DDA1同源进行检索在不同的数据库,广场上(http://bioinformatics.psb.ugent.be/plaza/),Phytozome(https://www.phytozome.net)Gramene(https://www.gramene.org),TAIR(https://www.arabidopsis.org),和GenBank中的(https://www.ncbi.nlm.nih.gov),使用Web托管应用BLAST(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)。所有截断DDA1序列被排除在随后的分析。序列使用对齐ClustalW2(https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/)与贡内特蛋白质比较矩阵和默认参数(空位开放罚0.1初始配对比对10和缺口延伸罚分;差距所述多个开口的0.210和缺口延伸罚点球排列;与残基的具体和亲水残基的处罚,间隙4分离距离和30%的延迟发散截止),然后手动检查,以检查可能的偏差(补充数据集1)。使用被选为最佳模型拟合的对齐ProtTest(阿瓦斯卡尔等人,2005),其对应于一个琼斯Taylor-氨基酸替代桑顿模型离散伽玛分布(4种),的不变的比例,和一个初始BIONJ树。这种模型被用来进行最大似然分析引导使用1000次重复使用的MEGA5(HTTP:// WWW。megasoftware.net/)软件。差距/缺少治疗参数为设置完成删除。更遥远的同源物,从卷柏moellendorffii和云杉青冈,被用作外群根的导致进化树。
2楼2014-12-09 12:58:21
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