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zawz99

新虫 (初入文坛)

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【答案】应助回帖

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玉砌的强: 金币+15, 翻译EPI+1, ★★★很有帮助 2014-12-09 21:54:10

种子萌发和幼苗建立测定种子表面消毒后，分层在黑暗中进行在4℃下3天。接着，100种子每种基因型的播种在MS平板缺乏或补充有0.5mM的ABA，150 mM氯化钠，或400毫甘露醇。在iDDA1行分析，使用与1 mMABAwas B-雌二醇加入到培养基中，在10mM的最终浓度如所述。得分种子发芽，胚根出现在播种后72和96小时进行分析。苗成立了进球后5天作为种子的百分比绿色发展子叶扩大和第一对真叶。根生长测定幼苗生长在垂直取向的MS平板进行4至5天。随后，20株植物被转移至新的MS平板缺乏或补充用10mM的ABA。将平板上扫描平板扫描仪10 d后产生图像文件适用于根的定量分析使用ImageJ1.37版本软件的增长系统发育分析DDA1同源进行检索在不同的数据库，广场上（http：//bioinformatics.psb.ugent.be/plaza/），Phytozome（https://www.phytozome.net）Gramene（https://www.gramene.org），TAIR（https://www.arabidopsis.org），和GenBank中的（https://www.ncbi.nlm.nih.gov），使用Web托管应用BLAST（https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi）。所有截断DDA1序列被排除在随后的分析。序列使用对齐ClustalW2（https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/）与贡内特蛋白质比较矩阵和默认参数（空位开放罚0.1初始配对比对10和缺口延伸罚分;差距所述多个开口的0.210和缺口延伸罚点球排列;与残基的具体和亲水残基的处罚，间隙4分离距离和30％的延迟发散截止），然后手动检查，以检查可能的偏差（补充数据集1）。使用被选为最佳模型拟合的对齐ProtTest（阿瓦斯卡尔等人，2005），其对应于一个琼斯Taylor-氨基酸替代桑顿模型离散伽玛分布（4种），的不变的比例，和一个初始BIONJ树。这种模型被用来进行最大似然分析引导使用1000次重复使用的MEGA5（HTTP：// WWW。megasoftware.net/）软件。差距/缺少治疗参数为设置完成删除。更遥远的同源物，从卷柏moellendorffii和云杉青冈，被用作外群根的导致进化树。

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2楼2014-12-09 12:58:21

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