24小时热门版块排行榜    

查看: 1817  |  回复: 3

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

[求助] 怎样确定DL_POLY软件FIELD文件中涉及氢键的VDW参数?力场选Dreiding力场。 已有1人参与

Dreding力场中关于H和F的力场参数如下:

ATOMTYPES
X          X            0.00000  0.0000 non    0 non      !Dummy forcefield type
H_         H          1.00800  0.0000 non    0 non      !hydrogen
H___A      H       1.00800  0.0000 non    0 non      !hydrogen, involved in hydrogen bonds
H___b      H       1.00800  0.0000 non    0 non      !hydrogen, bridging hydrogen



DIAGONAL_VDW
X                IGNORE       0.1000000000000000
H_             LJ_6_12       3.195000000000000       0.1520000000000000E-01
H___A       LJ_6_12       3.195000000000000       0.1000000000000000E-03
H___b       LJ_6_12       3.195000000000000       0.1520000000000000E-01

F_          LJ_6_12       3.472000000000000       0.7250000000000000E-01

对于HF分子,如果要考虑F-H...F-H的氢键作用,在 DL_POLY中怎么写L-J部分的分子间作用势?
VDW    3
F    F     lj   0.0725    3.472
F    H     lj   A             B                     !这部分有氢键作用
H    H     lj  0.0152    3.195      

怎样确定这里的A和B?
我提出两个可能:
(1)按照F  H___A来混合, 即用F_ 和H__A 的参数来混合;
(2)按照F  H来混合,即用F_和H_来混合。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lsloneil

专家顾问 (正式写手)

(1)吧,毕竟所有氢原子都参与到氢键里。
那么你在vdw中的氢原子为什么不用H_A而要用H_的LJ参数呢?
2楼2014-12-08 14:49:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

引用回帖:
2楼: Originally posted by lsloneil at 2014-12-08 14:49:42
(1)吧,毕竟所有氢原子都参与到氢键里。
那么你在vdw中的氢原子为什么不用H_A而要用H_的LJ参数呢?

H__A与F_可以描述氢键作用;那么H与H之前的作用呢?用H___A和H___A?还是H_和H_?
3楼2014-12-08 15:53:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lsloneil

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by cenwanglai at 2014-12-07 19:53:58
H__A与F_可以描述氢键作用;那么H与H之前的作用呢?用H___A和H___A?还是H_和H_?...

我觉得应该是H_a  H_a,因为氢键不是原子间的相互作用,而是分子间的。也就是说H_a-F, H_a - H_a之间的vdw相互作用+静电相互作用的协同效应才会产生氢键。
4楼2014-12-09 10:47:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cenwanglai 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 17:19 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 5/250 2026-08-08 17:02 by oEVWOejN9taj
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 5/250 2026-08-08 16:47 by oEVWOejN9taj
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 6/300 2026-08-08 15:07 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +5 布布和一二 2026-08-08 8/400 2026-08-08 14:54 by archvillain
[基金申请] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 4/200 2026-08-08 14:27 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 KXLV3nuBVBY7 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:07 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +11 且听虎啸 2026-08-07 14/700 2026-08-08 12:50 by 布布和一二
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 6/300 2026-08-08 10:19 by 3OOjAIS77qg2
[基金申请] 娱乐 +6 Tide man 2026-08-03 6/300 2026-08-07 22:40 by 铁帽子农民
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] 听说今天filecode变了 +24 布布和一二 2026-08-06 47/2350 2026-08-07 16:02 by zhiyanjiang
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 纯娱乐,不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
[基金申请] 面上提前没消息,有中的吗 +14 archvillain 2026-08-02 18/900 2026-08-04 14:42 by archvillain
信息提示
请填处理意见