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cenwanglai

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老和山猥琐派九段

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[求助] 怎样确定DL_POLY软件FIELD文件中涉及氢键的VDW参数?力场选Dreiding力场。 已有1人参与

Dreding力场中关于H和F的力场参数如下:

ATOMTYPES
X          X            0.00000  0.0000 non    0 non      !Dummy forcefield type
H_         H          1.00800  0.0000 non    0 non      !hydrogen
H___A      H       1.00800  0.0000 non    0 non      !hydrogen, involved in hydrogen bonds
H___b      H       1.00800  0.0000 non    0 non      !hydrogen, bridging hydrogen



DIAGONAL_VDW
X                IGNORE       0.1000000000000000
H_             LJ_6_12       3.195000000000000       0.1520000000000000E-01
H___A       LJ_6_12       3.195000000000000       0.1000000000000000E-03
H___b       LJ_6_12       3.195000000000000       0.1520000000000000E-01

F_          LJ_6_12       3.472000000000000       0.7250000000000000E-01

对于HF分子,如果要考虑F-H...F-H的氢键作用,在 DL_POLY中怎么写L-J部分的分子间作用势?
VDW    3
F    F     lj   0.0725    3.472
F    H     lj   A             B                     !这部分有氢键作用
H    H     lj  0.0152    3.195      

怎样确定这里的A和B?
我提出两个可能:
(1)按照F  H___A来混合, 即用F_ 和H__A 的参数来混合;
(2)按照F  H来混合,即用F_和H_来混合。
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)

(1)吧,毕竟所有氢原子都参与到氢键里。
那么你在vdw中的氢原子为什么不用H_A而要用H_的LJ参数呢?
2楼2014-12-08 14:49:42
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

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引用回帖:
2楼: Originally posted by lsloneil at 2014-12-08 14:49:42
(1)吧,毕竟所有氢原子都参与到氢键里。
那么你在vdw中的氢原子为什么不用H_A而要用H_的LJ参数呢?

H__A与F_可以描述氢键作用;那么H与H之前的作用呢?用H___A和H___A?还是H_和H_?
3楼2014-12-08 15:53:58
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by cenwanglai at 2014-12-07 19:53:58
H__A与F_可以描述氢键作用;那么H与H之前的作用呢?用H___A和H___A?还是H_和H_?...

我觉得应该是H_a  H_a,因为氢键不是原子间的相互作用,而是分子间的。也就是说H_a-F, H_a - H_a之间的vdw相互作用+静电相互作用的协同效应才会产生氢键。
4楼2014-12-09 10:47:43
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