哪位大神会用mac做本地blast啊？？？求教啦！！！ - 分子生物 - 生物信息

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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

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西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-12-16 18:47:13

引用回帖:

10楼: Originally posted by 佳璇sxj at 2014-12-15 10:15:05
请问用Mac终端做本地blast后，－out输出文件的格式是什么？我做的这个会出现这种问题，是不是格式不对，还是其他原因呢？求大神指教啦。。。

屏幕快照 2014-12-15 上午10.12.33.png
...

it has nothing to do with format. The error message is "File is not accessible". Make sure you have the write permission to the path you are working at, e.g. use command "ls -l > 001.txt" which lists all files and outputs the result to the file called 001.txt. If you get the message "Permission denied" then you do not have the permission to create that file.

regarding output format, it is -outfmt parameter, more details can be found by using blastn -help command