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敏sunflower金虫 (小有名气)
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退火过程 已有1人参与
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各位大侠,最近在用MS软件建立模型时,一直纠结于退火问题。还请大侠们有招支招,畅所欲言啊。。。。。。。 文献上面关于建立高分子聚合物初始模型的方法基本上都不大一样,又得文献建立初始模型后使用退火过程,有的则不用,我想问的是,建立模型时,使用退火有没有条件呐?或者说,在什么条件下才会使用退火过程呐?亦或是所有的聚合物模型都可以尝试使用退火过程? 关于退火过程,我不熟悉,里面的参数设置也很纠结。退火过程中起始温度、最高温度、温度间隔,动力学时间如何选择呐?尤其是最高温度该如何选择那? ![]() |
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敏sunflower
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2楼2014-12-03 09:31:33
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4楼2014-12-03 17:45:18
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楼主你好,现在我也是用到退火过程,也是看到了好多版本的帖子,自己算的时候经常报错,不知道哪个更靠谱一点....有没有谁做过退火过程不出错的.... 我先说说自己的,楼主帮我出出主意呗: 首先我的体系是PVAc单体数1700,另外还有6000个甲醇分子,1000个醋酸乙烯分子,总共分子数(聚合物按单体算)约8000~9000之间,原子数80000吧。整个过程中用的Forcite模块,没用Discover的。 1、分别构建PVAc1700,甲醇分子和醋酸乙烯分子,并都进行几何优化; 2、对PVAc1700进行退火处理,NPT系综下从300K~1000K~300K,这里温度的选择我也不清楚,只是按照高一点的温度选的; 3、对PVAc进行MD NVT平衡,然后用平衡后的结构+6000甲醇+1000醋酸乙烯去构建盒子。那么问题来了,构件时如果选择优化盒子结构,最后就会报错,因此我就选择了不优化结构; 4、构建出来的盒子,自己对其进行几何优化,然后再进行MD计算,MD计算到一半就会报错,说能量变化值超过了设定的50000。但是设定值50000一般是不可以修改的啊... 然后现在我就没辙了。。。不知道自己的退火是不是出了问题,导致结构没有松弛下来。。。 |

5楼2014-12-11 15:42:00














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