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泰山云巅

铜虫 (初入文坛)

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[求助] 拟南芥转基因苗中发现一个特异的株系,求研究办法

本虫子做功能基因,将一些基因转到拟南芥中验证其功能.本次做实验发现其中一个拟南芥株系的荚长变短为原长度的三分之二,而其他6个株系和野生型一样.估计是转入的基因使拟南芥中的某个基因丧失了功能,类似于人工突变.现在想研究发生这种变化的基因的功能,求研究思路及方法.更重要的是,这个是不是有意义,有没有人这样研究过.万能的虫子们,靠你们了...

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感性生活，理性做事

1楼 2014-12-01 11:57:16

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yudaoqian88

至尊木虫 (知名作家)

不良人

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专业: 作物种质资源与遗传育种学

【答案】应助回帖

首先是找插入位点，是那个基因的表达变化了…貌似有个T-DNA标签技术，可以找到目标位点…这个我不太清楚…
   然后是针对该基因的结构分析，把突变体中该序列的的全长序列克隆到，并与野生型比对，看是哪里出了问题，是不能转还是基因发生突变失火…
   用野生型的序列做blastn/p,看这个基因的功能，进化书分类，在别的模式植物中有啥作用，研究进展之类的…
然后进行表达模式研究，通过定量分析还基因是否发生了表达量变化～当然，前提是启东子发生变化了，要不可能在表达量上无变化…
如果该基因实在一个一个通路中起作用，可以做这个通路其他基因的表达量变化…
      接着做互补实验，在突变体表达正常基因看能否恢复表型…还是做定量验证真的高表达了…
      还可以做该基因的上下游调控基因…
      貌似基本的套路都是这样，具体我也不清楚哈…

[ 发自小木虫客户端 ]

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特别喜欢家门口开门的瞬间，宝宝那个高兴呀，蹦蹦跳跳，好不热闹！

2楼2014-12-01 12:14:34

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