| 查看: 121 | 回复: 0 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
[交流]
【求助】关于abmer中求resp电荷问题
|
|||
|
我是用amber去求某蛋白的resp电荷，并想转换成ac文件，但遇到了如下问题。请您帮忙看看。 For atom[1]:Fe1, the best APS is not zero, exit Warning: the assigned bond types may be wrong, please : (1) double check the structure (the connectivity) and/or (2) adjust atom valence penalty parameters in APS.DAT, and/or (3) increase MAXVASTATE in define.h and recompile bondtype.C (4) increase PSCUTOFF in define.h and recompile bondtype.C Be cautious, use a large value of PSCUTOFF (>10) will significantly increase the computer time 请问如何解读？最好详细些~~~ thanks~ |
回复此楼» 猜你喜欢
现招2026北京航空航天大学联培博士1名（北航学位）-材料AI方向
已经有3人回复
-
江苏科技大学2026年招聘启事
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有76人回复
-
普瓦捷环境与材料化学研究所 (IC2MP)博后招聘
已经有0人回复
-
香港科技大学(广州)方超课题组招聘全奖博士
已经有0人回复
-
宁夏大学化学工程与技术专业招收博士研究生
已经有1人回复
-
分子动力学 Plumed教程求助
已经有0人回复
-
南京大学软物质计算模拟方向硕博连读/直博生招生
已经有0人回复
-
International Journal of Nanoscience属于中科院4区吗？
已经有0人回复
-
研究生学术新锐奖｜宁波微纳材料研讨会参会通知
已经有2人回复