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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】二茂铁在MS中怎么构筑
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littlestone2006

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】二茂铁在MS中怎么构筑

如题，在MS中怎么构筑二茂铁分子让程序可以识别计算。我试了好多种方法，都不能识别计算（用Discover计算最优结构）含有二茂铁的衍生物。
请求高手指点。
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老老实实做人，踏踏实实做事！
1楼 2008-05-15 13:29:23
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hjlyyc

木虫 (知名作家)

无门派
★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎继续关注计算模拟版！
能否通过得到晶体数据得到二茂铁单元啊！
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天道酬勤!
2楼2008-05-15 13:49:32
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dongping001

木虫 (正式写手)
★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎继续关注计算模拟版！
关键是二茂铁分子的模建,可以用其它软件例如chemdraw画出其分子结构,化学键可以用虚键表示再存成ms可以识别的格式,再到ms的discover模块计算
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3楼2008-05-15 15:18:19
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hjlyyc

木虫 (知名作家)

无门派
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
用X射线衍射能够能够得到其真实的结构模型，应该比计算优化出的结构更准确吧！我看文献中进行计算中的模型就是X射线衍射得到的结构模型！
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天道酬勤!
4楼2008-05-15 16:50:00
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littlestone2006

银虫 (小有名气)
我是想能够让MS识别后模拟聚合物的优化结构。我有单体的单晶结构数据。但是不知道怎么建模可以让MS识别。我想做的是聚合物的结构优化，如果单体能识别了，聚合物模拟就没有问题了。
还请高手们指点呀！
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老老实实做人，踏踏实实做事！
5楼2008-05-16 00:16:53
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hjlyyc

木虫 (知名作家)

无门派
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢关注老帖 十大“耐思”版主评选欢迎参与投票 http://edu.emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=845527&fpage=1
最近我们用MS对二茂铁进行了优化，直接利用软件画一个二茂铁单元，利用Dmol3模块里的计算就可以进行结构和能量优化啦，优化函数可能根据自己的需要选择！
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天道酬勤!
6楼2008-06-19 21:58:45
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awpsr

金虫 (正式写手)

快快乐乐小青虫

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通过sketch fragment工具的fragment browser来定义茂基和配位中心，然后除氢键，这样和真实结构比较接近。再用DMol3优化结构，然后构建成无定形晶胞，再用Discover计算就可以识别了。
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世上本没有人， 路走多了便成了人
7楼2008-06-23 16:01:14
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