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littlestone2006

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】二茂铁在MS中怎么构筑

如题,在MS中怎么构筑二茂铁分子让程序可以识别计算。我试了好多种方法,都不能识别计算(用Discover计算最优结构)含有二茂铁的衍生物。
请求高手指点。
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hjlyyc

木虫 (知名作家)

无门派


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎继续关注计算模拟版!
能否通过得到晶体数据得到二茂铁单元啊!
天道酬勤!
2楼2008-05-15 13:49:32
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dongping001

木虫 (正式写手)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎继续关注计算模拟版!
关键是二茂铁分子的模建,可以用其它软件例如chemdraw画出其分子结构,化学键可以用虚键表示再存成ms可以识别的格式,再到ms的discover模块计算
3楼2008-05-15 15:18:19
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hjlyyc

木虫 (知名作家)

无门派


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
用X射线衍射能够能够得到其真实的结构模型,应该比计算优化出的结构更准确吧!我看文献中进行计算中的模型就是X射线衍射得到的结构模型!
天道酬勤!
4楼2008-05-15 16:50:00
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littlestone2006

银虫 (小有名气)

我是想能够让MS识别后模拟聚合物的优化结构。我有单体的单晶结构数据。但是不知道怎么建模可以让MS识别。我想做的是聚合物的结构优化,如果单体能识别了,聚合物模拟就没有问题了。
还请高手们指点呀!
老老实实做人,踏踏实实做事!
5楼2008-05-16 00:16:53
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hjlyyc

木虫 (知名作家)

无门派

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢关注老帖 十大“耐思”版主评选欢迎参与投票 http://edu.emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=845527&fpage=1
最近我们用MS对二茂铁进行了优化,直接利用软件画一个二茂铁单元,利用Dmol3模块里的计算就可以进行结构和能量优化啦,优化函数可能根据自己的需要选择!
天道酬勤!
6楼2008-06-19 21:58:45
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awpsr

金虫 (正式写手)

快快乐乐小青虫

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通过sketch fragment工具的fragment browser来定义茂基和配位中心,然后除氢键,这样和真实结构比较接近。再用DMol3优化结构,然后构建成无定形晶胞,再用Discover计算就可以识别了。
世上本没有人, 路走多了便成了人
7楼2008-06-23 16:01:14
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