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superfan

至尊木虫 (著名写手)

耕耘者

[交流] 【求助 InsightII 并行】谁知道如何将InsightII并行

我看到很多帖子讨论InsightII,但是好像没有关于如何并行的帖子。听别人说用MPICH可以,有用过的吗,请介绍一下,谢谢。
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sunmuer

木虫 (小有名气)

★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢
Insight II 可以并行计算的。这体现在它进行Discover的时候。
在你输入文件的最后一行输入一个np=2之类的命令,具体的名称忘记了。
出清水而不染
4楼2008-05-16 06:43:19
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

★ ★ ★ ★
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢
你好,因为我们实验室遇到过这个问题,因此老师特地给了我一个月的时间来研究这个问题,但得出的结果很让人失望。
并行化确实是解决计算速度的很好的一个方法,不过这个的前提一定要软件本身支持,还有你的问题我觉得不是特别清楚和理解,我只是按我的理解向您解释。MS可以的,有接口,但InsightII,sybyl之类的就不行,他们软件在设计时本身就没留并行运算的接口,只能升级硬件来提高速度。
另外更换硬件、升级版本是他们这些公司赚钱的基础。
希望能对你有所帮助
个人博客:[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
3楼2008-05-15 13:10:40
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superfan

至尊木虫 (著名写手)

耕耘者

谢谢gwdavid sunmuer

我们这里discover模块也可以并行,但是不知道charmm模块是否可以并行。至少现在还没有成功呵呵
5楼2008-05-17 00:45:09
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cuihang

铁杆木虫 (正式写手)

VASPer


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
mpirun -f 结点分配文件 -np 进程数 程序
聪明人知道自己是傻子,傻子以为自己是聪明人
6楼2008-05-17 09:12:15
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